分子相接打开酵素的功能

适合关键字到锁定里也许似乎象简单的任务，但是得克萨斯 A&M 大学的研究员使用介入测试千位关键字打开酵素的功能的方法，并且他们的发现可能打开新的目标的门的药物设计。

得克萨斯 A&M 研究员弗兰克 Raushel 是科学家的小组的一部分修改称 “分子相接的”技术预测哪个分子，称基体，触发酵素到活动，使他们解密在单独其结构基础上的酵素的功能。

小组的论文在日记帐本质被发表了。

多数生物学过程依靠酵素，是蛋白质加速化学反应，但是许多酵素的功能依然是奥秘。

“有可能是基体的千位分子 [为特定酵素]，并且它将花费太很多时间实际上测试他们全部”， Raushel 说。 “如此我们决定有需要对于一个新的方法确定酵素的功能”。

这个小组从酵素的三维 X-射线结构开始了然后使用计算机设法适合不同的更小的分子到酵素的有效的站点象部分的在难题。

“每酵素有特定范围和形状”， Raushel 说， “并且您能使用计算机采取小的分子，并且逐个适合他们到酵素的有效的站点和计分他们他们多么恰当适合了。 是或多或少象适合关键字到锁定，但是更大量困难的，因为酵素和这个基体是 conformationally 灵活的”。

在计算机计分分子后他们多么恰当适合酵素，它排列他们的顺序，并且研究员能然后使用这个优先安排的列表决定实际上测试的哪些分子。

“只要我们知道，这是任何人第一次使用分子相接预测酵素的功能”， Raushel 说。 “并且它由实验和 X-射线结晶学验证”。

其他方法研究员使用设法确定酵素的功能或基体特异性包括实际上测试的千位可能的分子，收集从附近的基因的信息和酵素的结构与那其他酵素与已知的功能比较。 “我认为最终，我们将必须一起使用所有这些方法”， Raushel 说。 “一个唯一方法就是不会足够了”。

Raushel 和他的小组计划持续使用他们的分子相接方法查找其他酵素的功能。

“我们查看有未知函数蛋白质的其他 X-射线结构，并且我们工作填补空白”， Raushel 说。 “我们设法发现将军此方法如何是或，如果我们在这个特定情况下公正幸运”。

Raushel 和得克萨斯 A&M 博士后的关联里卡多 Marti-Arbona 与布赖恩 Shoichet 一道运作在加州大学、旧金山和史蒂文 Almo 从医学阿尔伯特・爱因斯坦学院在纽约。

Raushel 希望以后五年，这个小组能开始使用其发现找出新的药物的潜在目标。

“了解某些酵素基体特异性可能允许研究员区分摧化在致病性有机体的一种回应和在人力资源系统的一种有些不同的回应的酵素”， Raushel 说。 “这将允许特别地会瞄准一个致病性有机体的科学家设计 [药物]，当不影响人力酵素时”。

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