分子相接打開酵素的功能

適合關鍵字到鎖定裡也許似乎像簡單的任務，但是得克薩斯 A&M 大學的研究員使用介入測試千位關鍵字打開酵素的功能的方法，并且他們的發現可能打開新的目標的門的藥物設計。

得克薩斯 A&M 研究員弗蘭克 Raushel 是科學家的小組的一部分修改稱 「分子相接的」技術預測哪個分子，稱基體，觸發酵素到活動，使他們解密在單獨其結構基礎上的酵素的功能。

小組的論文在日記帳本質被發表了。

多數生物學過程依靠酵素，是蛋白質加速化學反應，但是許多酵素的功能依然是奧秘。

「有可能是基體的千位分子 [為特定酵素]，并且它將花費太很多時間實際上測試他們全部」， Raushel 說。 「如此我們決定有需要對於一個新的方法確定酵素的功能」。

這個小組從酵素的三維 X-射線結構開始了然後使用計算機設法適合不同的更小的分子到酵素的有效的站點像部分的在難題。

「每酵素有特定範圍和形狀」， Raushel 說， 「并且您能使用計算機採取小的分子，并且逐個適合他們到酵素的有效的站點和計分他們他們多麼恰當適合了。 是或多或少像適合關鍵字到鎖定，但是更大量困難的，因為酵素和這個基體是 conformationally 靈活的」。

在計算機計分分子後他們多麼恰當適合酵素，它排列他們的順序，并且研究員能然後使用這個優先安排的列表決定實際上測試的哪些分子。

「只要我們知道，這是任何人第一次使用分子相接預測酵素的功能」， Raushel 說。 「并且它由實驗和 X-射線結晶學驗證」。

其他方法研究員使用設法確定酵素的功能或基體特異性包括實際上測試的千位可能的分子，收集從附近的基因的信息和酵素的結構與那其他酵素與已知的功能比較。 「我認為最終，我們將必須一起使用所有這些方法」， Raushel 說。 「一個唯一方法就是不會足够了」。

Raushel 和他的小組計劃持續使用他們的分子相接方法查找其他酵素的功能。

「我們查看有未知函數蛋白質的其他 X-射線結構，并且我們工作填補空白」， Raushel 說。 「我們設法發現將軍此方法如何是或，如果我們在這個特定情況下公正幸運」。

Raushel 和得克薩斯 A&M 博士後的關聯裡卡多 Marti-Arbona 與布賴恩 Shoichet 一道運作在加州大學、舊金山和史蒂文 Almo 從醫學阿爾伯特・愛因斯坦學院在紐約。

Raushel 希望以後五年，這個小組能開始使用其發現找出新的藥物的潛在目標。

「瞭解某些酵素基體特異性可能允許研究員區分摧化在致病性有機體的一種回應和在人力資源系統的一種有些不同的回應的酵素」， Raushel 說。 「這將允許特別地會瞄準一個致病性有機體的科學家設計 [藥物]，當不影響人力酵素時」。

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