Selectieve resequencing biedt low-cost methode voor de interpretatie van het menselijk genoom

Cold Spring Harbor, NY hebben Wetenschappers van Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) ontwikkelde een nieuwe manier van extraheren en interpreteren van gegevens uit het menselijk genoom, dat is krachtiger en zuiniger dan de methoden die momenteel gebruikt.

De nieuwe technologie, genaamd selectieve resequencing, belooft te worden een zegen voor vele soorten van onderzoek, met inbegrip van inspanningen te kammen uitgestrekte van het genoom voor de gemuteerde genen betrokken zijn bij ernstige ziekten zoals kanker en schizofrenie.

Een team onder leiding van CSHL's Gregory Hannon, Ph.D. een moleculaire en cel-bioloog, en W. Richard Mccombie, Ph.D., een moleculair bioloog die aan het hoofd van het Laboratorium van de gene sequencing centrum, zocht een efficiënte manier van het scheiden van wat het meest waardevol in het genoom van minder belangrijke stukken van genomische "code." In totaal zijn er meer dan 3 miljard 'letters' van de code in het menselijk genoom, slechts 2 procent van wat eigenlijk instrueert cellen te produceren eiwitten, de werkpaarden van alle levensprocessen.

Nieuwe methode CSHL is vernieuwend omdat het stelt genoom wetenschappers veel tijd en arbeid besparen door het vastleggen en dan sequencing, of "spelling uit," genoom code geruimd van relatief kleine, gerichte gebieden in tegenstelling tot sequencing het hele genoom en pas daarna honen in op gebieden van belang zijn.

"In praktische termen betekent dit dat een nieuwe wereld van ontdekking wordt opengesteld voor wetenschappers die geïnteresseerd zijn in het bestuderen van de genomen van grote groepen mensen op een vergelijkende basis die is een prima basis voor onze inzichten over gen-mutaties die ziekte veroorzaken," zei Dr Hannon.

Dr Mccombie toegevoegd: "Door wetenschappers een klein deel van het genoom doel, onze methode maakt het mogelijk voor mensen met interessante ideeën, te veel werk te doen, op een bescheiden budget. Dit zal bieden onderzoekers de kans om genoeg monsters echt zinvolle genoom-brede vergelijkende studies uit te voeren zijn. "

http://www.cshl.org/