300 の前に未確認の人間の遺伝子の発見

コルネルで他のほ乳類のそれらとヒトゲノムの部分を、研究者は比較するスーパーコンピュータを使用して約 300 の前に未確認の人間の遺伝子を検出し、数百の遺伝子の拡張を既に知られていて見つけました。

発見は、違った方法の有機体の変更のために有用な何かをする遺伝コードのセクション考えに有機体が展開すると同時に基づいています。

研究はアダム Siepel、コルネルの生物的統計量および計算の生物学、 Brona Brejova コルネルのポストドクターおよびジャーナルゲノムの研究のオンラインバージョンの他の何人かの施設の同僚のによって助教授報告され、 12 月プリント版で書かれています。

完全なヒトゲノムは前に数年配列されましたが、遺伝コードを構成するベースと呼出される 3 十億の順序かそう化学単位知られていることをそれは単に意味します。 残るものが蛋白質のためにコードするか、または規定する行うまたは他の機能ですすべての短いセクションの厳密な位置の識別。

20,000 以上の蛋白質コーディングの遺伝子は、そうコルネルの貢献、間重要、劇的に変更しません知られていた遺伝子の番号を識別されました。 重要である何が、研究者は言いましたり、そこの発見ショーがまだ現在の生物的方法を使用して抜けていたもっとたくさんの遺伝子であることができることです。 これらの方法は広く表現されるが、である特定のティッシュにだけまたは萌芽期の開発の初期に表現されるそれらが抜けることがあります遺伝子を見つけることで非常に有効と、 Siepel は言いました。

「改革を」とこれらの遺伝子を識別するのに使用しているかエキサイティングである何が Siepel は言いました。 「改革は何百万のずっと年のためのこの実験をしています。 コンピュータはです結果を観察する私達の顕微鏡」。

4 つのベース -- 文字 G、 C、 A および T によって一般に参照されて -- DNA を構成して下さい。 3 つのベースはアミノ酸 (蛋白質のブロック) のために続けてコードしこれらの 3 文字コードの一連は遺伝子、セルが蛋白質に作ることができるアミノ酸の一連のためのコーディングである場合もあります。

Siepel および同僚は 「節約された」遺伝子を見つけるために着手しました -- それはすべての生命に基本的であり、それは何百万の改革の年に同じを、または、ほぼそうとどまりました。

研究者は他の労働者が検出した 「アラインメントから」開始しました -- 2つ以上の種を渡って大抵同様である数千ベースまで長く伸びます。 高度の計算のためのコルネルの中心の 850 ノードクラスタを含む大規模なコンピュータクラスタを使用して、研究者は 3 つのアルゴリズム、または計算デザインを実行しました -- そのうちの一つは Siepel 作成しました -- さまざまな組合せの人間、マウス、ラットおよび鶏間のこれらのアラインメントを比較するため。

何百万の年に、個々のベースは交換することができます -- C に G、 T から A、例えば -- 損傷か miscopying によって。 変更します蛋白質の構造を有機体を殺すか、または見込みなしの発展の経路の下の送ることができる変える。 しかし節約された遺伝子は蛋白質をジョブをすることできる去る小変更だけ含んでいます。 コンピュータはによってこのモデルに作成遺伝子がどのようにの変更するかもしれませんかそれらの種類の変更の領域をそれから捜す数学的モデルの一致します捜しました。

既に知られていた遺伝子に一致させた予言を除去した後、研究者は実際は遺伝子の多数が人間のティッシュのサンプルで見つけ、蛋白質のためにコードすることができると証明する実験室の余りをテストしました。 研究者は知られていた蛋白質のデータベースと比べて蛋白質を識別時々できました。 検出された遺伝子は自発運動量、細胞粘着、結合組織および中枢神経系の開発の多くの異なった創造物に共通であると期待されるかもしれない機能と主にしなければなりません。

建物およびテストからの全体のプロジェクトは、最終的な実験室試験の実行への数学的モデル、約 3 年を取りましたと、 Siepel は言いました。 作業は国立癌研究所、全米科学財団の早い経歴開発グラントおよび卒業生の研究団体カリフォルニア大学によってサポートされました。

http://www.cornell.edu/