Używać superkomputer porównywać porcje ludzki genom z tamto inni ssaki przy Cornell, badacze odkrywali niektóre 300 poprzednio niezidentyfikowanych ludzkich genów i zakładają rozszerzenia kilkaset geny już znać.
Odkrycie opiera się na pomysle który gdy organizmy rozwijają, sekcje genetyczny kod które robią coś pożytecznie dla organizm zmiany w innych sposobach.
Badanie donosi asystentem profesora, Cornell postdoctoral badaczem Brona Brejova i kolegami przy kilka innymi instytucjami w online wersi czasopismo genomu badanie Adam Siepel, Cornell, i ono pojawiać się w Grudnia druku wydaniu.
Zupełny ludzki genom uporządkowywał kilka rok temu, ale to po prostu znaczy że rozkaz 3 miliard, w ten sposób chemiczne jednostki lub które uzupełniali genetycznego kod bazy dzwoniący, znamy. Co zostaje jest identyfikacją dokładna lokacja wszystkie krótkie sekcje lub inne funkcje które koduje dla protein lub wykonuje wykonawczy.
Więcej niż 20.000 cyfrowań genów utożsamiali, w ten sposób Cornell wkład dramatycznie no zmieniają liczby znać geny., podczas gdy znaczący, Co jest znacząco badacze mówją, są, że ich odkrycie przedstawienia tam wciąż być jeszcze więcej genów które brakowali używać aktualne biologiczne metody. mogli Te metody są bardzo wydajne przy znalezienie genami które szeroko wyrażają ale mogą brakować tamto które wyrażają tylko w pewnych tkankach lub przy wczesnymi fazami embrionalny rozwój, Siepel powiedział.
"Co jest podniecający używa ewolucję utożsamiać te geny," Siepel powiedział. "ewolucja robił ten eksperymentowi dla millions rok. Komputer jest nasz mikroskopem obserwować rezultaty."
Cztery różnej bazy -- powszechnie nawiązywać do listy G, C, A i T, -- uzupełniał DNA. Trzy bazy z rzędu kodować dla amino kwasu mogą, (elementy proteiny) i sznurek te listów kody może być genem, koduje dla sznurka amino kwasy którym robić w proteinę może komórka.
Siepel i koledzy wykładaliśmy znajdować geny które "chronili" -- to jest fundamentalny wszystkie życie i to zostawał to samo nad millions rok ewolucja prawie w ten sposób, lub.
Badacze zaczynali z "wyrównaniami" odkrywającymi innymi pracownikami -- rozciągliwość do kilka tysiąc baz które są przeważnie podobne przez dwa lub więcej gatunki. tęsk Używać na dużą skalę komputer gromadzi się, wliczając 850 guzków grona przy Cornell centrum dla Postępowy Obliczać badacze biegali trzy różnego algorytmu lub obliczać projekty, -- jeden z czego Siepel tworzył -- porównywać te wyrównania między istotą ludzką, myszą, szczurem i kurczakiem w różnorodnych kombinacjach.
Nad millions rok, indywidualne bazy mogą zamieniający -- C, G, na przykład -- awaryjnym lub miscopying. Zmienia który zmienia strukturę proteina może zabijać organizmu lub wysyłać je puszek martwy koniec ewolucyjna ścieżka. Ale chroniący geny zawierają tylko małe zmiany które opuszczają proteinę sprawnie robić swój pracie. Komputer patrzejący dla regionów z tamte rodzajami zmiany to tworzyć matematycznie modela, then patrzejący dla dopasowań modela. jak gen można zmieniać
Po eliminować przepowiednie które dopasowywali już znać geny badacze badali ostatek w laboratorium, udowadnia że dużo geny mogli w rzeczywistości znajdujący w próbkach ludzka tkanka i mogli kodować dla protein. Badacze byli czasem sprawnie utożsamiać proteiny przez porównanie z bazami danych znać proteiny. Odkrywający geny głownie robić z motorową aktywnością, komórki przyleganiem, łącznikową tkanką i centrala układu nerwowego rozwojem muszą, funkcje które można oczekiwać być pospolite wiele różne istoty.
Całkowity projekt od budynku i testowanie matematycznie modele działający definitywni laboranccy testy, wziąć wokoło trzy roku, Siepel powiedział. Praca wspierał narodowy instytut badań nad rakiem, narodowej fundaci naukowa kariery Wczesnym rozwojem Grant i uniwersyteta kalifornijskiego absolwenta badania poczetem.
http://www.cornell.edu/