Μια διεθνής συνεργασία τους προέκυψε από ερευνητές στις ΗΠΑ και η Νότια Αφρική ανακοίνωσαν την πρώτη αλληλουχία του γονιδιώματος ενός εκτενώς τα ανθεκτικά στα φάρμακα (XDR), στέλεχος του βακτηρίου Mycobacterium tuberculosis, το ένα συνδέεται με περισσότερους από 50 θανάτους σε μια πρόσφατη φυματίωση (TB) εμφάνιση στο KwaZulu -Natal, Νότια Αφρική.
Ως μέρος αυτού του έργου, τα γονιδιώματα της πολυανθεκτικής (MDR) και τα ναρκωτικά ευαίσθητα στελέχη ήταν επίσης αποκωδικοποιηθεί. Οι αρχικές συγκρίσεις των αλληλουχιών του γονιδιώματος αποκαλύπτουν ότι η ανθεκτικών στα φάρμακα και τα ναρκωτικά ευαίσθητα μικρόβια διαφέρουν σε μόνο λίγες δεκάδες θέσεις κατά μήκος του κώδικα του DNA τεσσάρων εκατομμυρίων επιστολή, αποκαλύπτοντας μερικά γνωστά γονίδια αντίστασης στα φάρμακα, καθώς και ορισμένες επιπλέον γονίδια που μπορεί επίσης να σημαντική για την εξάπλωση της φυματίωσης. Οι ερευνητές έχουν λάβει ένα ασυνήθιστο βήμα της αμέσως καταμερισμό τόσο της ακολουθίας του γονιδιώματος και η αρχική ανάλυση τους πολύ πριν από την υποβολή επιστημονική εργασία, προκειμένου να επιταχυνθούν οι εργασίες για την πολυανθεκτική φυματίωση από τους ερευνητές σε όλο τον κόσμο.
«Η φυματίωση είναι μια σημαντική απειλή για την παγκόσμια δημόσια υγεία που απαιτεί νέες προσεγγίσεις για τη διάγνωση και θεραπεία ασθενειών», δήλωσε ο Megan Murray, ένας από τους κύριους ερευνητές του έργου, συνδεδεμένο μέλος του Ινστιτούτο Broad του MIT και του Χάρβαρντ και αναπληρωτής καθηγητής στο Harvard Σχολή Δημόσιας Υγείας. "Με την εξέταση των γονιδιωμάτων των διαφόρων στελεχών, μπορούμε να μάθουμε πώς το μικρόβιο της φυματίωσης outwits τώρα τα φάρμακα και πώς τα νέα φάρμακα θα μπορούσε να σχεδιαστεί."
"Γονιδίωμα πληροφοριών είναι ένα ισχυρό εργαλείο για την κατανόηση της βιολογίας των μολυσματικών ασθενειών, όπως η φυματίωση», δήλωσε ο Eric Lander, ιδρυτικός διευθυντής των Γενικών Ινστιτούτου Harvard και το MIT. «Είναι σημαντικό ότι genomic στοιχεία να γίνουν άμεσα διαθέσιμα, ιδιαίτερα για τους ερευνητές σε περισσότερες περιοχές επιβαρύνονται ιδιαίτερα από την ασθένεια."
"Το στέλεχος αλληλουχία είναι υπεύθυνη για τη συντριπτική πλειονότητα των περισσότερων από 300 περιπτώσεις XDR εντοπιστεί μέχρι στιγμής στο KwaZulu-Natal επαρχία της Νότιας Αφρικής», δήλωσε ο Willem Sturm, ένας από τους κύριους ερευνητές του έργου και ο κορυφαίος ερευνητής της επιδημίας XDR σε KwaZulu-Natal, κοσμήτορας του Νέλσον Μαντέλα School of Medicine, και διευθυντής του MRC γεννητικών Ασθενειών Ερευνητική Μονάδα έλκος στο Πανεπιστήμιο του KwaZulu-Natal. "Γενετική χαρακτηρισμός αυτού του στελέχους είναι απαραίτητη για την ανάπτυξη εργαλείων για να πάρει αυτή την επιδημία υπό έλεγχο."
Σε παγκόσμιο επίπεδο, η φυματίωση (ΤΒ) είναι μια σημαντική αιτία της λοιμώδους νόσου θανάτων. Σχεδόν 2 δισεκατομμύρια άνθρωποι, εκ των οποίων περίπου το ένα τρίτο του παγκόσμιου πληθυσμού, η σκέψη για τη μεταφορά M. tuberculosis, το βακτήριο ένοχος. Σημαντικά εμπόδια για τον έλεγχο του στελέχους της νόσου από την ικανότητα του μικροβίου να αποφύγει τις σημερινές θεραπείες, οι οποίες απαιτούν συνήθως παρατεταμένη χρήση από ασθενείς και συχνά δεν είναι θεραπευτική. MDR στελέχη, για παράδειγμα, είναι ανθεκτικά σε δύο από τα πιο αποτελεσματικά φάρμακα πρώτης γραμμής της φυματίωσης, καθώς και στελέχη XDR μπορεί να παρακάμψει πρώτης γραμμής, καθώς και ορισμένα φάρμακα δεύτερης γραμμής. Η προσθήκη του προβλήματος, αναποτελεσματικές διαγνωστικές μέθοδοι για τη φυματίωση καθιστούν δύσκολο για τους γιατρούς για να καθορίσει αν ένα άτομο λιμάνια ενός φαρμάκου-ανθεκτικό στέλεχος, συχνά καθυστερεί την κατάλληλη θεραπεία.
Για να ρίξει φως στις γενετικές αλλαγές που μεσολαβούν αντοχή στα φάρμακα, μια διεθνής ομάδα επιστημόνων ανέλαβε μια μεγάλης κλίμακας προσπάθεια για την αλληλουχία του γονιδιώματος των ναρκωτικών ευαίσθητα, MDR και XDR TB απομονώνει από ένα στέλεχος υπεύθυνο για την τρέχουσα επιδημία XDR-TB σε KwaZulu -Natal, Νότια Αφρική. Αυτό το στέλεχος αντιστοιχεί σε εκείνο που είχε διαπιστωθεί σε ασθενείς με Tugela Ferry, μια αγροτική πόλη σε KwaZulu-Natal που έχει βιώσει πρόσφατα μια σοβαρή επιδημία της εξαιρετικά πολυανθεκτικής φυματίωσης σε ασθενείς που έχουν μολυνθεί με τον ιό της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας (HIV). Εκεί, 52 από 53 άνθρωποι έχουν μολυνθεί από αυτό το στέλεχος πέθανε. Η έρευνα αντανακλά μια συνεργασία μεταξύ των ερευνητών στη μικροβιακή Κέντρο αλληλουχίας στο Ινστιτούτο Broad του Harvard και το MIT, Μέγκαν Μάρεϊ της Σχολής Δημόσιας Υγείας του Χάρβαρντ, και Willem Sturm και οι συνεργάτες του στο Νέλσον Μαντέλα Ιατρικής Σχολής στη Νότια Αφρική.