Sebuah kolaborasi internasional yang dipimpin oleh peneliti di AS dan Afrika Selatan telah mengumumkan urutan genom pertama dari luas tahan obat (XDR) strain bakteri Mycobacterium tuberculosis, satu dihubungkan dengan lebih dari 50 kematian dalam tuberkulosis baru (TB) wabah di KwaZulu -Natal, Afrika Selatan.
Sebagai bagian dari pekerjaan ini, genom multi-obat resisten (MDR) dan isolat yang sensitif obat juga diterjemahkan. Perbandingan awal urutan genom mengungkapkan bahwa mikroba resistan terhadap obat dan obat-sensitif berbeda hanya pada lokasi beberapa lusin sepanjang kode DNA empat juta huruf, mengungkapkan beberapa gen resistensi obat dikenal serta beberapa gen tambahan yang juga dapat penting bagi penyebaran TB. Para peneliti telah mengambil suatu langkah yang tidak biasa segera berbagi baik urutan genom dan analisis awal mereka jauh sebelum mengirimkan makalah ilmiah, dalam rangka untuk mempercepat bekerja pada resistan terhadap obat TB oleh para peneliti di seluruh dunia.
"Tuberkulosis merupakan ancaman utama bagi kesehatan masyarakat global yang menuntut pendekatan baru untuk diagnosis penyakit dan pengobatan," kata Megan Murray, salah satu peneliti utama proyek, anggota asosiasi dari Institut Broad dari MIT dan Harvard dan seorang profesor di Harvard School of Public Health. "Dengan melihat genom dari strain yang berbeda, kita dapat mempelajari bagaimana mikroba TB mengecoh obat saat ini dan bagaimana obat baru mungkin dirancang."
"Informasi Genom adalah alat yang ampuh untuk memahami biologi penyakit menular, seperti tuberkulosis," kata Eric Lander, direktur pendiri Institut Broad dari Harvard dan MIT. "Sangat penting bahwa data genomik dibuat segera tersedia, khususnya untuk para peneliti di daerah yang paling berat dibebani oleh penyakit."
"Strain sequencing bertanggung jawab atas sebagian besar dari lebih dari 300 kasus XDR diidentifikasi sejauh ini di provinsi KwaZulu-Natal Afrika Selatan," kata Willem Sturm, salah satu peneliti kepala proyek dan seorang peneliti terkemuka dari epidemi TB di KwaZulu-Natal, dekan Nelson Mandela Fakultas Kedokteran, dan direktur Unit Penelitian Penyakit Bisul MRC genital di University of KwaZulu-Natal. "Karakterisasi genetik strain ini sangat penting untuk mengembangkan alat untuk mendapatkan epidemi ini di bawah kontrol."
Secara global, tuberkulosis (TB) adalah penyebab utama kematian penyakit menular. Hampir 2 miliar orang, yang terdiri dari sekitar sepertiga dari populasi dunia, diperkirakan untuk membawa M. tuberculosis, bakteri penyebab. Hambatan utama untuk mengendalikan penyakit batang dari kemampuan mikroba untuk menghindari pengobatan saat ini, yang biasanya membutuhkan penggunaan jangka panjang oleh pasien dan sering tidak kuratif. Strain MDR, misalnya, yang resisten terhadap dua obat lini pertama yang paling efektif TB, dan strain TB dapat menghindari lini pertama serta beberapa obat lini kedua. Menambahkan untuk masalah ini, metode diagnostik untuk TB tidak efisien membuat sulit bagi dokter untuk menentukan apakah seorang individu pelabuhan strain yang resistan terhadap obat, sering menunda terapi yang tepat.
Untuk menjelaskan perubahan genetik yang memediasi resistensi obat, sebuah tim internasional ilmuwan melakukan upaya besar-besaran untuk urutan genom obat sensitif, MDR, dan TB-XDR isolat dari strain bertanggung jawab atas epidemi TB-XDR saat ini di KwaZulu -Natal, Afrika Selatan. Regangan ini sesuai dengan yang ditemukan pada pasien di Tugela Ferry, sebuah kota pedesaan di KwaZulu-Natal yang baru saja mengalami wabah parah di antara pasien TB-XDR terinfeksi dengan human immunodeficiency virus (HIV). Di sana, 52 dari 53 orang yang terinfeksi dengan jenis virus ini meninggal dunia. Penelitian ini mencerminkan sebuah kolaborasi antara para peneliti di Pusat Sekuensing Mikroba di Institut Broad dari Harvard dan MIT, Megan Murray dari Harvard School of Public Health, dan Willem Sturm dan koleganya di Nelson Mandela Medical School di Afrika Selatan.