細胞追踪軟件加速藥物開發

時間就是金錢，尤其是在比賽中發現新的抗炎藥，並把他們推向市場。

百萬計的人，如心髒病，中風，關節炎和多發性硬化症等疾病的新藥物可以提高治療。然而，一個發現過程中的關鍵部分 - 監測活體組織中的白血細胞的運動和速度 - 涉及的繁瑣，往往存在固有的缺陷手工小時。

CellTrek，細胞跟踪軟件開發由弗吉尼亞大學隊工程和應用科學的研究人員學院，跳躍啟動電流跟踪方法，以提供自動化解決方案的一個根本問題：如何跟踪快速移動，往往模糊不清，細胞在體內的要求，或生活環境。 CellTrek本質上的“噪音”也被稱為白細胞周圍的白血細胞，通過削減，因此，研究人員可以收集快速，準確的數據，他們可以用它來形容炎症過程的強度。

“這些細胞的速度和密度的炎症水平的關鍵指標，解釋說：”斯科特阿克頓，CellTrek的開發和電氣和計算機工程教授之一。速度的不同分佈的“細微之處 [可以]實際上表明不同的事情生物學家。一件事情是評估一種遺傳缺陷，或某些基因的存在，或存在一個說的應該是消炎藥物甚至親炎症，所以，以調查有關的炎症過程中的所有這些假設的微血管[小血管，你能夠計數和跟踪體內細胞，白細胞，的。“

阿克頓，其專長在於圖像分析技術，如圖像分割和運動跟踪，有專門的軍事目標的運動 - 如車輛和坦克等大型物體。與克勞斯萊伊，生物醫學工程教授，博士的機會會談在2000年，在細胞水平上一個新的重點對象上。萊伊，最近被任命為炎症在加州拉霍亞過敏及免疫學研究所生物學處處長，是一種在炎症過程中的活組織的生物力學專家。

“當斯科特來到弗吉尼亞大學副教授，幾年前，我去他的談話，因為它是有關跟踪和我是在跟踪[白細胞]有興趣，曾嘗試過許多不同的算法，與不同的工程師，”萊伊回憶。 “已經跟踪他在環法自行車賽的車手 ... ...從直升機上，直升機移動。動議的騎自行車，有時騎自行車將進入一個小的森林消失，將另一端出來，他仍然能夠跟踪他們。想，'好吧，如果他能跟踪這個東西，他肯定能追踪這些細胞。“

“他解決了跟踪未標記的白細胞在活體組織問題，沒有人做之前。”

阿克頓，萊伊和校友亞當 Goobic（工程'02，'03），開發 CellTrek的專有軟件，解決相關的跟踪與體內問題。而不是跟踪只是幾十個手工白細胞 - 這個過程可能需要幾小時或幾天 - 使用CellTrek的研究人員現在可以一次追踪成千上萬的細胞。自動化的收集過程中，也消除了人為錯誤，因為研究人員很容易引入意想不到的偏差（即選擇對他人的某些細胞）。稱為“抖動”，其中的圖像轉變突然，由於主體的呼吸和循環系統，效果還可以引入錯誤。

CellTrek在成本，時間和精度優於手工跟踪。它的技術，認為在其他生物醫學研究中的應用的承諾，如跟踪微泡超聲引導下的分子成像和給藥。

“由於數據收集的問題確實是這個炎症性疾病的過程中發現的障礙，”阿克頓說，“我認為我們在生物學分析工具正在開發，以解決有關的發病率的許多奧秘，應導致死亡率盡可能人類疾病，但輸入端是一個到達那裡的主要障礙。“

展望未來，阿克頓認為，工程師，生物學家和醫生，將會發現更多領域的交集。 “我認為在未來 10年將是一個偉大的革命，”他說。 “信息的結合，我們從我們從遺傳學獲得的信息與圖像分析 - 。採取這種投入什麼所謂的系統生物學模型... ...做到這一點的人都喜歡電腦的人之間的和生物學的人的組合，他們正在使用這些仿真工具模擬的事情發生在體內，如炎症過程。弗吉尼亞大學是成為在這一領域的領導者，而不是在一個 [小]一塊拼圖，它試圖尋找在整個謎題，操縱整個機器。“

目前，研究小組希望市場 CellTrek通過一個啟動，只需跟踪公司阿克頓說，除了CellTrek，“現在，有沒有在體內目前的解決方案。

“我們不成立的商務人士，”他說，“但是我們的科學家和工程師誰想要得到的產品，其他的科學家，以便發現可能會加快。”

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