Naukowowie przy instytutem dla system biologii we współpracy z badaczami od Nowy Jork uniwersyteta (NYU), rozwijali modela który wartko charakteryzuje poziom i precyzyjnie przepowiada, mechanistyczna odpowiedź utrzymanie komórka genetyczne i środowiskowe zmiany. (ISB)
Papierowy opisywanie EGRIN model publikował dzisiaj w onlinym wydaniu czasopismo komórka.
Wiedza zyskująca przez Środowiskowego i genu Wykonawczego oddziaływania modela demonstruje (EGRIN) że ja jest ewentualny odkrywać i otwiera drzwi powikłana inżynieria genetyczna która produkuje mniej niezamierzone konsekwencje. jak powikłani biologiczni systemy pracują
Mechanicy mogą załatwiać samochody, ponieważ znają wszystkie części pojazd czemu, jak, co robić przypuszcza each część części przypuszczają pracować wpólnie i zdarza się gdy części są ubranym out przez czas lub przerwy funkcjonuje opłata outside wpływa. Biolożki, na innej ręce, kłopotu naprawianie and/or reengineering komórki spisują nie mówiąc o zrozumieniu ponieważ no mają całościowych cząsteczkowych części jak tamte części pracują wpólnie udogadniać zdrowy funkcjonować.
Rozplątywać powikłane biologiczne sieci jest" powiedział Nitin Baliga, Ph.D., profesor nadzwyczajny przy ISB. "dlaczego przychodziłem ISB," "genomy więcej niż 500 organizmów uporządkowywali, mimo to my gdy społeczność naukowa zna bardzo trochę o jak ich biologiczne sieci funkcjonują. "
Systemu podejście biologia udowadniał być spektakularnym sukcesem w dokonywać cząsteczkowego równego zrozumienie powikłana biologia na przykład, ", z czego założyciele ISB byli wczesnymi mistrzami, która jest konieczna jeżeli jesteśmy konstruować komórki z powrotem zdrowie lub reengineer organizmy ulepszać bioenergy bioremediation lub produkcję," Baliga powiedział.
EGRIN modelują łączących biologicznych procesy z poprzednio niewiadomymi cząsteczkowymi związkami i precyzyjnie przepowiadający nowy przepis zna biologicznych procesy i transcriptional odpowiedzi całkowicie nowatorscy eksperymenty więcej niż 1.900 genów genetyczni i środowiskowi.
Baliga i koledzy używaliśmy Halobacterium salinarum NRC-1, członek Archaea rodzina organizmy, ponieważ ja był tematem stosunkowo mała naukowa nauka. Archael organizmy są evolutionarily odrębni od dwa innych form życie, Eukaryotes i Prokaryotes. Rozwijali prosperować w srogich środowiskach które byli śmiercionośni najwięcej innych organizmów. Jako rezultat, ich unikalna biologia mógł zapewniać nowych rozwiązania wyzwania w środowiskowym kontaminowaniu, produkci energii i opiece zdrowotnej.
Pracować z organizmem pozwolił Baliga lab demonstrować wartość brać systemu podejście który może prowadzić błyskawiczny odkrycie struktura i funkcja w niewystudiowanych biologicznych sieciach., o którym stosunkowo trochę zna
"zdolność zbierać ten poziom informacja co do biednie charakteryzującego organizmu od pojedynczej nauki jest znacząca i bezprecedensowy," Baliga powiedział. "W dodatku jest taki natura EGRIN model że ono jest obowiązujący wiele powikłane biologiczne sieci. "