Научные Работники на Институте для Биологии Систем (ISB), в сотрудничестве с исследователями от Университета Нью Йорка (NYU), начинали модель которая быстро характеризует и точно предсказывает молекулярн-уровень, mechanistic реакцию свободн-живя клетки к генетическим и относящим к окружающей среде изменениям.
Бумага описывая модель EGRIN была опубликована сегодня в он-лайн варианте Клетки журнала.
Знание приобретенное через модель Относящих К Окружающей Среде и Джина Регламентационную Влияния (EGRIN) демонстрирует что возможно открыть как сложные биологические системы работают и раскрывает дверь к более сложной генной инженерии которая производит men6we непреднамеренных последствий.
Механики могут исправить автомобили потому что они знают все части корабля, предположены, что делает какая каждая из частей, как части предполагаемы работать совместно и что случается когда части носят вне над действовать времени или стопа должный к снаружи влияет на. Биологи, с другой стороны, имеют отладку тревоги и/или клетки reengineering потому что они не имеют всесторонние молекулярные части перечисляют уже не говоря о вникании как те части работают совместно для того чтобы облегчить здоровый действовать.
«Unraveling сложные биологические сети почему Я пришел к ISB,» сказал Nitin Baliga, Ph.D., адъюнкта-профессора на ISB. «Были sequenced Геномы больше чем 500 организмов, но мы по мере того как научное сообщество знает очень немногую о как их биологические сети действуют. »
«Системный подход к биологии, чего основатели ISB были предыдущими чемпионами, доказывал быть эффектным успехом в достигать молекулярного ровного вникания сложной биологии, которая необходима если мы проектировать клетки назад к здоровью или reengineer организмы для того чтобы улучшить продукцию или биоремедиацию bioenergy, то например,» Baliga сказало.
EGRIN моделируют соединенные биологические процессы с ранее неизвестными молекулярными отношениями и точно предсказанная и новая регулировка знает биологические процессы и transcriptional реакции больше чем 1.900 генов к вполне романным генетическим и относящим к окружающей среде экспериментам.
Baliga и коллегаы использовали salinarum NRC-1 Halobacterium, член семейства Archaea организмов, потому что предмет относительно немного научного изучения. Организмы Archael evolutionarily определены от 2 других форм жизни, Эукариотов и Prokaryotes. Они эволюционировали для того чтобы преуспевть в жестковатых окружающих средах которые были бы летальны к большинств другим организмам. В результате, их уникально биология смогла снабдить новые разрешения возможности в относящом к окружающей среде загрязнении, производстве энергии и медицинском соревновании.
Работа с организмом о котором относительно немногая знано позволила лаборатории Baliga продемонстрировать значение принимать системный подход, который может вести к быстрому открытию структуры и функции в unstudied биологических сетях.
«Способность собрать этот уровень информации относительно бедно, котор характеризуют организма от одиночного изучения значительно и беспрецедентно,» Baliga сказало. «В добавлении, природа модели EGRIN такое что она применима к много сложных биологических сетей. »