Forskare på Institutet för SystemBiologi (ISB), i samarbete med forskare från den New York Universitetar (NYU), har framkallat en modellera som karakteriserar snabbt och förutsäger exakt detjämna mechanistic svaret av enuppehälle cell till genetiska och miljö- ändringar.
Det pappers- beskriva EGRINEN modellerar publicerades i dag i den on-line upplagan av föra journal överCellen.
Kunskapen som nås till och med det Miljö- och Genen som, Reglerande Påverkan (EGRIN) modellerar, visar att det är möjligheten som upptäcker, hur komplexa biologiska system fungerar och öppnar dörren till mer komplex genteknik som producerar mer få unintended följder.
Mekaniker kan fixa bilar, därför att de vet alla delar av ett medel, vad varje del är förment att göra, hur delarna är förment att fungera tillsammans och vad händer, när delar ha på sig ut med tiden eller, stoppa att fungera tack vare utanför påverkan. Biologer, har å andra sidan att besvära fixande, och/eller reengineeringceller, därför att de inte har en omfattande molekylär reservdelslista, låter bara en överenskommelse av hur de delar fungerar tillsammans för att göra sunt fungera lättare.
”Knyter kontakt att Riva Upp komplext biologiskt är, därför Jag kom till ISB,” sade Nitin Baliga, Ph.D., en förbunden professor på ISB. ”Har genom av mer än 500 organismer ordnats, yet vi, som en vetenskaplig gemenskap vet mycket lite om hur deras biologiskt knyter kontakt, fungerar. ”,
”Att närma sig har systemen till biologi, som grundarearna av ISB var tidig sortmästare av, bevisat att vara en spektakulär framgång, i att uppnå en molekylär jämn överenskommelse av komplex biologi, som är nödvändig, om vi ska iscensätta celler som är tillbaka till vård- eller reengineer organismer för att förbättra bioenergyproduktion eller bioremediation, till exempel”, sade Baliga.
EGRINNA modellerar anknutit biologiskt bearbetar med föregående okända molekylära förhållanden och förutsade exakt både den nya regleringen av vet att biologiskt bearbetar och de transcriptional svaren av mer än 1.900 gener till fullständigt nya genetiska och miljö- experiment.
Baliga och kollegor använde den Halobacterium salinarumen NRC-1, en medlem av den Archaea familjen av organismer, därför att det har varit betvinga av förhållandevis lite vetenskaplig studie. Archael organismer är evolutionarily distinkt från två annan bildar av liv, Eukaryotes och Prokaryotes. De har evolved för att blomstra i hårda miljöer som skulle är dödliga till mest andra organismer. Som ett resultat kunde deras unika biologi ge nya lösningar till utmaningar i miljö- förorening, energiproduktion och sjukvård.
Arbetet med en organism, som förhållandevis lite om är bekant tillåtet det Baliga labbet som visar värdera av att ta, system att närma sig, som kan leda till forupptäckten av strukturerar och fungerar i unstudied biologiskt knyter kontakt.
”Är kapaciteten att samla detta jämnt av information angående en dåligt karakteriserad organism från en singelstudie viktig, och aldrig tidigare skådat,”, sade Baliga. ”I tillägg, modellerar naturen av EGRINEN är sådan att den är tillämpbar till många komplext biologiskt knyter kontakt. ”,