Syntetisk fremstillet korte protein fragmenter, eller peptider, er et vigtigt redskab for forskere og læger.
Men peptid produktionen er dyrt og tidskrævende. Forskere ved det tyske Cancer Research Center (Deutsches Krebsforschungszentrum, DKFZ) har nu formået at generere peptider på en mikrochip - en metode, der er hurtigere og dermed billigere end tidligere.
Syntetiske peptider er uundværlige for en lang række biokemiske og diagnostiske detektion processer som paavisning af antistoffer, der giver forskerne til at diagnosticere sygdomme. Dr. Volker Stadler, Associate Professor Dr. Ralf Bischoff og lektor Dr. Frank Breitling har udviklet en ny teknik til at generere peptider direkte på en mikrochip. Metoden er meget effektiv: Mens konventionelle peptid chips giver en tæthed på 22 peptider per kvadratcentimeter, de DKFZ Microchip leverer 40.000 forskellige peptider per kvadratcentimeter.
Hvis forstørret mange gange, mikrochippen ligner en kæmpe skakbræt. Proteinet fragmenter er samlet på torve trin for trin fra deres byggesten, de 20 aminosyrer. Det er muligt at vælge en anden sekvens af disse byggesten på hver firkant. I begyndelsen er de aminosyrer integreret i faste pellets. Elektriske felter direkte de piller til det rigtige sted på chippen. Når matchende aminosyrer ligger på hver firkant, de piller smeltet og aminosyrer frigøres. Således er det muligt at tilføje en byggeklods til alle 40.000 peptider på chippen på samme tid. Andre metoder har brug for flere skridt til at gøre dette.
Forskerne håber, at det vil være muligt en dag at fremstille mikrochips med flere tusinde peptider for blot et par cents. Ved hjælp af konventionelle metoder, produktion af peptider i så store mængder koster flere tusinde euro. "Vores metode vil fremme forskningsprojekter, der ville simpelthen have været for dyrt før," sagde Ralf Bischoff.