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Sequenziamento diretto di singoli filamenti di RNA con la punta avanzata spettroscopia Raman

Published on January 28, 2008 at 6:26 PM · No Comments

L'alfabeto genetico contiene quattro lettere. Anche se le nostre cellule possono facilmente decifrare le nostre molecole genetica, non è così facile per noi leggere una sequenza di DNA in laboratorio. Gli scienziati richiedono complesse tecniche altamente sofisticate di analisi del DNA per rompere i codici individuali.

Volker Deckert e il suo team presso l'Istituto per Analytical Sciences (SISSA) di Dortmund hanno recentemente sviluppato un metodo che potrebbe fornire un modo per sequenze di DNA direttamente. Il loro processo si basa su una combinazione di spettroscopia Raman e microscopia a forza atomica. Come riportato sulla rivista Angewandte Chemie , Deckert e Elena Bailo hanno analizzato con successo parente più prossimo del DNA, l'RNA.

Sequenziamento diretto significa che le lettere del codice genetico sono lette direttamente, come se con una lente d'ingrandimento. Un filamento di DNA o RNA ha un diametro di soli due nanometri, così l'ingrandimento deve essere altrettanto forte. Deckert squadra utilizza un microscopio a forza atomica per raggiungere questo livello di ingrandimento. Guidato dal microscopio, una piccola punta di vetro argentato si muove sopra il filamento di RNA. Un fascio laser focalizzato sulla punta eccita la sezione del filo in esame e inizia a vibrare. Lo spettro della luce diffusa (spettro Raman) fornisce informazioni molto precise sulla struttura molecolare del segmento. Ogni genetico "lettera", cioè ognuno degli acidi nucleici, vibra in modo diverso e quindi ha una caratteristica spettrale "impronta digitale".