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Malaysia-Genom-Institut bringt Bioinformatikforschung unter Verwendung SGI-Technologie voran

Published on February 21, 2008 at 1:04 PM · No Comments

Um einen optimalen Arbeitsfluß zu erstellen der die verschiedenen Datenverarbeitungsanforderungen der Bioinformatikforschung umgibt, wählte das Malaysia-Genomics- (MGI)Institut SGI aus um eine eindeutige hybride Datenverarbeitungslösung SGI zu konstruieren.

Weil Bioinformatikforschung eine Vielzahl der Software in verschiedenen Stadien im Arbeitsfluß verwendet, kann der kombinierte Gebrauch Teilenspeicher Anlagen und Cluster eine optimale Umgebung für den effizienten Gebrauch von jeder Anwendung zur Verfügung stellen. MGI schaute zu SGI, um einen nahtlosen, zusammenhängenden Arbeitsfluß für den Gesamtprozess zu konstruieren, der in die vorhandene Infrastruktur integrieren würde. SGI entband eine hybride Datenverarbeitungslösung, die dem neuen SGI BioCluster sowie aus einem SGI besteht (R) Altix (R) Server des geteilten Speichers und ein SGI (R) Dateisystem gemeinsam benutztes InfiniteStorage CXFS (TM) SAN, das den gesamten Arbeitsfluß transparent zum Benutzer unabhängig davon die eingesetzte Software oder Stufe des Prozesses macht, an dem Wissenschaftler durchführen.

„Bioinformatik bringt eine Lawine von systematischen biologischen Daten mit der analytischen Theorie zusammen und praktische Hilfsmittel von Mathematik und von Informatik,“ sagte Matte Isa, LaborManager, Malaysia-Genom-Institut Mohd Noor. „SGI entband die flexible Datenverarbeitung mit einer hybriden Architektur, die Hochdurchsatz, leistungsstarke und FPGA-basierte Lösungen für alle unsere Bioinformatikanwendungen integriert -- eine Lösung, die nahtlos Anwendungen in der Umgebung ausführt, die bestgeeignet ist für optimale Leistung.“

Genomische sequenziell ordnende Operationen verwenden Anwendungen wie PHRAP, Staden-Paket, JAZZ, Consed und SPRENGEN jedes mit den spezifischen Berechnungsanforderungen, die mehrfache Anlagen erfordern. Die Lösung SGI BioCluster umfaßt eine Software-Schicht, welche die transparente Arbeitsbelastung bereitstellt, die einplant durch, welche Benutzer Jobs ohne Kleinteilinteressen eingeben können. Die Verwaltungssoftware der SGI-Lösung gibt intelligent der Unterordnungen, um auf der passenden Plattform ausgeführt zu werden und stellt beste in klasseleistung und das optimale Belastungsausgleichen zur Verfügung. Integrierte ClusterFührungsinstrumente und dynamische Software-Bediengeräte können die Gesamtanlage von einem einzelnen Meta-cluster zu den teilautonomen Unterclustern ändern, wie Bedarf vorschreibt. Für unerwartete zeit-kritische Datenverarbeitungsherausforderungen aktiviert die hybride Lösung SGI Verwalter, alle verfügbaren Mittel zu holen, um einen einzelnen Job zu betreffen.