Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Finnish | Bahasa | Русский | Svenska | Polski

マレーシアのゲノムの研究所 SGI の技術を使用するバイオインフォマティクス研究を進歩します。

Published on February 21, 2008 at 1:04 PM · No Comments

バイオインフォマティクス研究の多様なコンピューティング要件を網羅する最適なワークフローを作成するには、独自の SGI ハイブリッドはコンピューティング ソリューションを設計する SGI マレーシア ゲノム研究所 (MGI) を選択します。

バイオインフォマティクス研究、さまざまなソフトウェアのさまざまな段階のワークフローで使用するため、共有メモリ ・ システムおよびクラスターの併用は各アプリケーションの効率的な使用のための最適な環境を提供できます。MGI は、既存のインフラストラクチャに統合し、全体のプロセスをシームレスに統合されたワークフローをデザインする SGI に見えた。SGI は、コンピューティングの新しい SGI バイオクラとして、SGI(R) Altix(R) 共有メモリ サーバーで構成されるソリューションと全体のワークフロー ソフトウェアの採用に関係なく、ユーザーに透過的に SGI(R) InfiniteStorage CXFS(TM) 共有 SAN ファイル ・ システム、ハイブリッドやステージでの科学者を実行しているプロセスの配信。

「バイオインフォマティクス雪崩の体系的な生物学的データ分析の理論と数学とコンピューター科学の実用的なツールまとめ「モハド ヌール マット Isa 研究室マネージャー、マレーシア ゲノム所と述べた。「SGI 高スループット、高パフォーマンスと FPGA ベースのソリューションのすべて私たちバイオインフォマティクスのアプリケーション - シームレス最高の環境でのアプリケーションのパフォーマンスを最適に最適を実行するソリューションを統合し、ハイブリッド アーキテクチャの柔軟なコンピューティングします配信。」

ゲノム シーケンスの操作、PHRAP、Staden パッケージ、ジャズ、Consed などのアプリケーションを活用し、それぞれ特定の計算の要件の複数のシステムを必要と爆発します。SGI バイオクラ ソリューションには、透過的なワークロードをユーザーがハードウェアの問題のないジョブを送信できるスケジュールを提供するためのソフトウェア レイヤーが含まれます。SGI ソリューションの管理ソフトウェアは、インテリジェントにクラス最高のパフォーマンスと最適なロード ・ バランシングを提供、適切なプラットフォームで実行する提出をキューします。ニーズ統合されたクラスター管理ツールとソフトウェアの動的コントロール システムは 1 つのメタ-クラスターから自律 sub-clusters に変更できます。予期しないタイム クリティカルなコンピューティング課題、SGI ハイブリッド ソリューションに 1 つのジョブを負担するすべての利用可能なリソースにできます。

MGI、別名 GENOMalaysia、ゲノム配列のプロジェクトを通して熱帯生物資源の探索研究を実施、ネットワーク ベースの組織、比較ゲノミクス、構造生物学です。いくつかの主要な研究プロジェクトは現在 MGI で進行中です。たとえば、微生物ゲノム研究遺伝子と自然の製品の探索プロジェクトの 2 つのモデル生物イネ pseudomallei、ローカルで重要な土壌病原菌・ アイメリア ・ テネラ、ローカル鳥原虫に注力しています。プロジェクトの新しい洞察力と病原性、抗生物質耐性、宿主特異感染を得るために、有機体のゲノムを解剖する SGI ソリューションはハーネスします。

研究所も、南極研究グループ、大学タスマニア州では、Wellcome の信頼・ サンガー研究所、スタンフォード大学のシェフィールド大学、英国を含む世界中の大学や研究所とのコラボレーションします。

SGI は、チャネル パートナー量子 Beez Sdn Bhd 社 (旧としてオープン ソース システムと呼ばれる) の設計および MGI の SGI ハイブリッド ソリューションを開発する仕事。

「マレーシアのゲノムの研究所最高の 2 つの個別のコンピューティング環境活用を 1 つ、統合プラットフォームに必要な: 大きい共有メモリ システムの高パフォーマンス ・ コンピューティング、およびクラスター ベースのシステムの高スループット、両方共有、妥協のないデータを提供、SGI InfiniteStorage CXFS 共有 SAN ファイル ・ システムによってサポートされてコンピューティング改善されたワークフロー、およびこれらデータの集中的な環境のコストを削減、「ディーパック Thakkar、高等教育と研究セグメントのマネージャー、SGI と述べた。「SGI が 1 つの強力なソリューションが 2 つのアーキテクチャと高速 SAN インフラストラクチャすべてデータに直接アクセスを生産します。このハイブリッド ソリューション最適なリターンの投資異機種混在またはマルチ ベンダー ベースのワークフローを提供します。

http://www.sgi.com/