생물정보학 연구의 다양한 계산 필수품을 포위하는 최적 워크 플로우를 만들기 위하여는, 말레이지아 유전체학 학회는 (MGI) 유일한 SGI 잡종 계산 해결책을 디자인하도록 SGI를 선정했습니다.
생물정보학 연구가 워크 플로우에 있는 각종 단계에서 다양한 소프트웨어를 이용하기 때문에, 공유하 기억 장치 시스템과 다발의 결합한 사용은 각 응용의 능률적인 사용을 최적 환경을 제공할 수 있습니다. MGI는 SGI에 기존 기반으로 통합할 전과정을 위한 이음새가 없고는, 점착력이 있는 워크 플로우를 디자인하기 위하여 봤습니다. SGI는 새로운 SGI BioCluster 뿐 아니라 SGI로 이루어져 있는 잡종 계산 해결책을 전달했습니다 (R) Altix (R) 공유 기억 장치 서버와 SGI (R) 전체 워크 플로우를 채택된 소프트웨어 또는 과학자가 능력을 발휘하고 있는 프로세스의 단계에 관계 없이 사용자에게 투명한 시키는 InfiniteStorage CXFS (TM) SAN 공유 파일 시스템.
"생물정보학 분석적인 이론을 가진 체계적인 생물학 데이터의 눈사태를 소집하고 수학과 컴퓨터 과학의 실제적인 공구,"는 Mohd Noor 매트 Isa 의 실험실 매니저, 말레이지아 게놈 학회를 말했습니다. "SGI는 우리의 생물정보학 응용 전부를 위한 높 처리량의, 고성능의 및 FPGA 기지를 둔 해결책을 통합하는 잡종 아키텍쳐로 유연한 계산을 전달했습니다 -- 이음새가 없 환경에 있는 응용을 달리는 해결책은 최적 성과를 위해 가장 적합했습니다."
Genomic 연속 작동은 PHRAP와 같은 응용 Staden 포장, 재즈, Consed를 이용하고, 다중계를 필요로 하는 특정 계산 필수품에 각각을 폭파합니다. SGI BioCluster 해결책은 어느 사용자가를 통해서 계획하는 기계설비 관심사 없이 투명한 표준 노동량을 제공하는 소프트웨어 층을 일을 제출할 수 있는지 포함합니다. SGI 해결책의 행정 소프트웨어는 적합한 플래트홈에 달리기 위하여 지적으로 제출을 큐를 보내, 최고 에서 종류 성과와 최적 부하 조정을 제공하. 필요가 지시하다 것과 같이 통합 다발 관리 도구 및 동적인 소프트웨어 통제는 단 하나 메타산 다발에서 반 자치 이하 다발에 종합 시스템을 바꿀 수 있습니다. 예상치 않은 시간 중요한 계산 도전을 위해, SGI 잡종 해결책은 관리자를 모든 단 하나 일을 관계가 있기 위하여 가용자원을 가져오는 가능하게 합니다.
MGI, 일컬어 GENOMalaysia는 게놈, 비교 연속에 있는 계획사업을 통해, 열대 bioresources에 대한 네트워크 베이스 편성부대 실행 발견 연구와 기능적인 유전체학 및 구조상 생물학입니다. 몇몇 중요한 연구 계획은 MGI에 현재 진행중입니다. 예를 들면, 유전자와 자연 산물 발견 계획사업을 위한 미생물 유전체학 연구는 2개의 모형 유기체, Burkholderia pseudomallei, 현지에 중요한 토양 병원체 및 Eimeria tenella, 현지 새 protozoan에 집중하고 있습니다. 계획사업은 SGI 유기체의 독성, 항생 저항, 호스트 특이성 및 전염성에 새로운 통찰력을 얻기 위하여 게놈을 해부하도록 해결책을 이용할 것입니다.
학회는 또한 타스마니아의 대학, 셰필드의 Wellcome 신망 Sanger 학회, 대학, UK 및 스탠포드 대학에 남극 대륙 연구 단체를 포함하여 그밖 연구 기관 그리고 대학으로, 세계적으로 공저합니다.
SGI는 (먼저 열려있는 근원 시스템으로 알려져 있는) 채널 통신로 파트너 Quantum Beez Sdn Bhd로 MGI를 위한 SGI 잡종 해결책을 디자인하고 개발하기 위하여 작동했습니다.
"말레이지아 게놈 학회는 2개의 명백한 계산 환경의 베스트를 레버리지를 도입하는 단 하나의, 통합 계산 플래트홈을 필요로 했습니다: , 및 높은 처리량 계산을 위한 다발 기지를 둔 시스템 계산하는, 고성능을 위한 더 큰 공동 메모리 시스템 비타협적인 자료 공유를 제공하는 SGI InfiniteStorage CXFS SAN 공유 파일 시스템에 의해 지원되는 둘 다, 이 데이터 집중적인 환경을 위한 향상된 워크 플로우 및 감소된 비용," Deepak Thakkar, 고등 교육 및 연구 세그먼트 매니저, SGI를 말했습니다. "SGI는 모든 데이터에 2 아키텍쳐를 가진 1개의 강력한 해결책 및 무작위 접근을 위한 고속 SAN 기반을 일으켰습니다. 이 잡종 해결책은 전달합니다 이질 다중 공급자 기지를 둔 워크 플로우를 위한 투자 수익 최적."
http://www.sgi.com/