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El Instituto del Genoma de Malasia avance la investigación de la bioinformática usando Tecnología del SGI

Published on February 21, 2008 at 1:04 PM · No Comments

Para crear un flujo de trabajo óptimo que abarca los requisitos que calculan diversos de la investigación de la bioinformática, el Instituto de la Genómica de Malasia (MGI) seleccionó el SGI para diseñar una solución que calculaba híbrida única del SGI.

Porque la investigación de la bioinformática utiliza una variedad de software en los diversos escenarios en el flujo de trabajo, el uso combinado de los sistemas y de los atados de la compartir-memoria puede proporcionar a un ambiente óptimo para el uso eficiente de cada aplicación. MGI observaba al SGI para diseñar un flujo de trabajo inconsútil, cohesivo para el todo el proceso que integraría en la infraestructura existente. El SGI entregó una solución que calculaba híbrida que consiste en el nuevo SGI BioCluster así como un SGI (R) Altix (R) servidor y un SGI (R) el sistema de ficheros de la memoria compartida compartida de InfiniteStorage CXFS (TM) SAN, que hace el flujo de trabajo entero transparente al utilizador sin importar el software empleado o el escenario del proceso en el cual los científicos se están realizando.

La “Bioinformática reúne un alud de datos biológicos sistemáticos con la teoría analítica y las herramientas prácticas de las matemáticas y de informática,” dijo la Estera AIA, Gerente del Laboratorio, Instituto de Mohd Noor del Genoma de Malasia. El “SGI entregó calcular flexible con una configuración híbrida que integra las soluciones de la alto-producción, de alto rendimiento y FPGA-basado para todas nuestras aplicaciones de la bioinformática -- una solución que inconsútil ejecuta aplicaciones en el ambiente best suited para el rendimiento óptimo.”

Las operaciones de secuencia Genomic utilizan las aplicaciones tales como PHRAP, Conjunto de Staden, JAZZ, Consed, y VUELAN cada uno con los requisitos específicos del cálculo que necesitan sistemas múltiples. La solución del SGI BioCluster incluye una capa del software que proporciona a la carga de trabajo transparente que programa a través de qué utilizadores pueden someter trabajos sin preocupaciones de la dotación física. El software administrativo de la solución del SGI cuenta inteligente presentaciones para ejecutarse en la plataforma apropiada, proporcionando a funcionamiento de la mejor-en-clase y al equilibrio óptimo de carga. Las herramientas de gestión Integradas del atado y los mandos dinámicos del software pueden cambiar el sistema total de un único meta-atado a los sub-atados semi-autónomos como las necesidades dictan. Para los retos que calculan de puntualidad crítica inesperados, la solución híbrida del SGI permite a administradores traer todos los recursos disponibles para referir un único trabajo.