Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Ελληνικά | Русский | Svenska | Polski

De Nieuwe software vindt 11 genetische variaties om te typen - diabetes 2

Published on March 25, 2008 at 2:20 AM · No Comments

De Wiskundigen bij de Technologische Universiteit van Michigan hebben krachtige nieuwe hulpmiddelen ontwikkeld om de genen achter wat van hardnekkigste ziekten van het mensdom uit te ziften de.

Met één, kunnen zij door generaties terug gieten om de genen achter geërfte ziekte aan te wijzen. Met een andere, hebben zij 11 variaties binnen genen - genoemd enig nucleotidepolymorfisme, SNPs of „knipt“ - verbonden aan type - diabetes 2 geïsoleerd.

„Met chronische, complexe ziekten zoals Parkinson, diabetes en ALS [de ziekte van Lou Gehrig], zijn de veelvoudige genen geïmpliceerd,“ bovengenoemde Qiuying Sha, een hulpprofessor van wiskundige wetenschappen. „U hebt een krachtige test nodig.“

Die test is de het Leren van het Ensemble Benadering (ELA), software die een reeks van SNPs kan ontdekken dat gezamenlijk een significant effect op een ziekte heeft.

Met complexe geërfte voorwaarden, met inbegrip van type - diabetes 2, enige genen kan de ziekte op hun storten, terwijl andere genen ziekte veroorzaken wanneer zij samen handelen. In Het Verleden, die dit gen-gen vinden is de combinaties vooral onhandelbaar geweest, omdat de berekeningen verdachte genen onder 500.000 moesten omhoog aanpassen of zo in het menselijke genoom vrijwel onmogelijk zijn geweest.

ELA wijkt dit probleem, eerst door het gebied van potentieel gevaarlijke genen drastisch te versmallen, en tweede uit, door statistische methodes toe te passen om te bepalen welke handeling SNPs op hun en welke handeling in combinatie. „Wij dachten het vrij koel was,“ bovengenoemde Sha.

Om hun model op echte gegevens te testen, analyseerde het team van Sha genen van meer dan 1.000 mensen in het Verenigd Koninkrijk, de helft met type - diabetes 2 en de helft zonder. Zij identificeerden 11 SNPs die, afzonderlijk of in paren, met de ziekte met een hoge graad van waarschijnlijkheid verbonden zijn. Hun werk is goedgekeurd door de dagboek Genetische Epidemiologie en geweest beschikbaar online in http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/117890704/ABSTRACT.