新しいソフトウェアはタイプ 2 の糖尿病に 11 の遺伝の変化を見つけます

ミシガン州の科学技術大学の数学者は人間性の最も扱いにくい病気のいくつかの後ろの遺伝子をふるいにかけるための強力な新しいツールを発達させました。

1 つを使うと受継がれた病気の後ろの遺伝子を正確に示すために、彼らは生成を通って投げてもいいです。 別のものによって、彼らはタイプ 2 の糖尿病によって関連付けられる遺伝子内の 11 の変化 - 呼出された単一のヌクレオチドの多形、 SNPs または 「スニップ」 - を隔離しました。

「慢性と、複雑な病気はパーキンソンを好みます、糖尿病および ALS [ルー・ゲーリック病]、多重遺伝子は複雑です」、 Qiuying Sha を数理科学の助教授言いました。 「必要とします強力なテストを」。

そのテストはアプローチ、一組 (ELA)の SNPs を検出できるソフトウェアを学ぶアンサンブルです共同で病気に対する重要な効果をもたらす。

複合体によって受継がれる条件と、タイプ 2 の糖尿病を含んで、単一の遺伝子は一緒に機能するとき他の遺伝子により病気を引き起こすが病気を自分自身で沈殿させるかもしれません。 以前、ずっとこれらの遺伝子遺伝子の組合せを見つけることはずっとヒトゲノムの 500,000 の中の疑わしい遺伝子をまたはそう調和させるのに必要とされる計算が事実上不可能であるので、特に扱いにくいです。

ELA は徹底的に危険を伴う遺伝子のフィールドを、 SNPs のどの行為自分自身でどれを組合せかの行為定めるために統計的な方法の適用によって二番目に狭くすることによってこの問題を、最初に、回避し。 「私達はそれがかなり涼しかった」とことを考えました Sha は言いました。

実質データのモデルをテストするためには、 Sha のチームはイギリスの 1,000 人上のからの遺伝子、タイプ 2 の糖尿病との半分および半分を外に分析しました。 それらは、単独でまたはペアの確率の高度と病気に、リンクされる 11 SNPs を識別しました。 作業はジャーナル遺伝の疫学によって受け入れられ、 http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/117890704/ABSTRACT でオンラインで手続きできます。

ELA が病気関連の遺伝子を解決するために無関係な個人の遺伝の構成を比較するのに使用されています。 チームはまた創設者の表現型を組み込む二段式連合テストを使用する行っている家族生成のゲノムを検査できる TTFP と呼出される別のアプローチ、開発しました。

「以前、研究者は核家族、親および子供に対処しましたが、これは祖父母、あなたまで遡って大き祖父母に…戻ることができますほしいです」。

チームは人類遺伝学のヨーロッパジャーナルの調査結果を出版しました。 概要は http://www.nature.com/ejhg/journal/v15/n11/abs/5201902a.html で使用できます。

それらがソフトウェアを開発したので、分析は比較的簡単、言います Sha をです。 しかし遺伝データを得ることは働くためにありません。 「私達はまだと働くデータセットを持っていません」と彼女は言いましたり、はっきり失望させました。 「である衛生学校を持っていないことを用いる問題」。

http://www.mtu.edu/