新的软件查找 11 基因差异对第二类型糖尿病

密执安技术大学的数学家开发了为吹开基因的强大的新工具在一些人类的最难处理的疾病后。

一，他们可以通过生成转换精确定位在被继承的病症后的基因。 别的，他们查出在基因内的 11 差异 - 叫的唯一核苷酸多形性、 SNPs 或者 “剪” - 与第二类型糖尿病相关。

“与慢性，复杂疾病喜欢帕金森的，糖尿病和 ALS [肌萎缩性侧索硬化症]，多基因是包含的”，一位助理教授说邱英 Sha，数学。 “您需要一个强大的测试”。

该测试是了解途径， (ELA)可能检测一套 SNPs 共同地有对疾病的重大的作用的软件的合奏。

对于复杂被继承的条件，包括第二类型糖尿病，唯一基因可能独自地沉淀这个疾病，而其他基因导致疾病，当他们一起时操作。 以前，因为必要的计算配合在 500,000 中的可疑的基因余在人类基因组是实际上不可能的，查找这些基因基因组合是特别笨重的。

ELA 通过猛烈缩小可能有危险的基因的域回避此问题，首先，和其次，通过运用统计方法确定哪次 SNPs 操作独自地，并且哪些在组合的操作。 “我们认为相当冷静”， Sha 说。

要测试他们的在实际数据的设计， Sha 的小组在英国分析从 1,000 个人的与第二类型糖尿病的基因，一半和一半无。 他们识别，唯一地或在对，与这个疾病被链接与高度概率的 11 SNPs。 他们的工作由日记帐基因流行病学接受了并且是可以在网上进行的在 http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/117890704/ABSTRACT。

ELA 用于比较无关的单个基因构成整理疾病关连的基因。 这个小组也开发了另一个途径，使用一个两阶段关联测试合并创建者的表现型，称 TTFP，可能检查的家庭成员染色体去生成。

“以前，研究员处理了核心家庭、父项和子项，但是这可能回到祖父项，曾祖父…早在您希望”。

这个小组在人类遗传学欧洲日记帐上发布了他们的发现。 摘要是可用的在 http://www.nature.com/ejhg/journal/v15/n11/abs/5201902a.html。

即然他们开发了这个软件，这个分析是相对地简单的，说 Sha。 但是获得基因数据运作不是。 “我们没有数据集从事与”，她说，明显地失败。 “不是有医学院的问题”。

http://www.mtu.edu/