Mathematicians på Michigan den Teknologiska Universitetar har framkallat kraftigt nytt bearbetar för att fläkta ut generna bak några av mänsklighet mest intractable sjukdomar.
Med en kan de cast tillbaka till och med utvecklingar för att precisera generna bak övertagen sjuka. Med another har de isolerat 11 variationer inom gener - kallade singelnucleotidepolymorphisms, SNPs eller ”snips” - som är tillhörande med typ - 2 sockersjuka.
”Med kroniskt, komplexa sjukdomar lika Parkinsons, sockersjuka och ALS [Lou Gehrig's Disease], är multipelgener involverade,”, sade Qiuying Sha, en assistentprofessor av matematiska vetenskaper. ”Behöver Du ett kraftigt testar.”,
Det testar är Helheten som Lärer, Att närma sig (ELA), programvara som kan avkänna en uppsättning av SNPs, som har gemensamt ett viktigt att verkställa på en sjukdom.
Med det övertagna komplex villkorar, inklusive typ - 2 sockersjuka, singelgener kan påskynda sjukdomen på deras eget, fördriver andra gener orsakar sjukdomen, när de agerar tillsammans. I det förgånget har att finna dessa gen-genen kombinationer varit speciellt otympligt, därför att beräkningarna som behövs för att matcha upp misstänkt gener bland 500.000na eller så i människagenom, har varit faktiskt omöjliga.
ELA sidesteps detta problem, först, genom drastiskt att begränsa sätta in av potentiellt farliga gener och understöder, genom att applicera statistiska metoder för att bestämma vilken SNPs agerar på deras eget och vilka agerar i kombination. ”Tänkte Vi att den var nätt kyler,”, sade Sha.
Att testa deras modellera på verkliga data, Shas laget analyserade gener från över 1.000 folk i Förenade kungariket, halva med typ - 2 sockersjuka och halva without. De identifierade 11 SNPs som, enkelt eller parvis, anknytas till sjukdomen med en kickgrad av probabilityen. Deras arbete har accepterats av den Genetiska Epidemiologyen för föra journal över och är tillgängligt direktanslutet på http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/117890704/ABSTRACT.