新的軟件查找 11 基因差異對第二類型糖尿病

密執安技術大學的數學家開發了為吹開基因的強大的新工具在一些人類的最難處理的疾病後。

一，他們可以通過生成轉換精確定位在被繼承的病症後的基因。 別的，他們查出在基因內的 11 差異 - 叫的唯一核苷酸多形性、 SNPs 或者 「剪」 - 與第二類型糖尿病相關。

「與慢性，複雜疾病喜歡帕金森的，糖尿病和 ALS [肌萎縮性側索硬化症]，多基因是包含的」，一位助理教授說邱英 Sha，數學。 「您需要一個強大的測試」。

該測試是瞭解途徑， (ELA)可能檢測一套 SNPs 共同地有對疾病的重大的作用的軟件的合奏。

對於複雜被繼承的條件，包括第二類型糖尿病，唯一基因可能獨自地沉澱這個疾病，而其他基因導致疾病，當他們一起時操作。 以前，因為必要的計算配合在 500,000 中的可疑的基因餘在人類基因組是實際上不可能的，查找這些基因基因組合是特別笨重的。

ELA 通過猛烈縮小可能有危險的基因的域迴避此問題，首先，和其次，通過運用統計方法確定哪次 SNPs 操作獨自地，并且哪些在組合的操作。 「我們認為相當冷靜」， Sha 說。

要測試他們的在實際數據的設計， Sha 的小組在英國分析從 1,000 個人的與第二類型糖尿病的基因，一半和一半無。 他們識別，唯一地或在對，與這個疾病被鏈接與高度概率的 11 SNPs。 他們的工作由日記帳基因流行病學接受了并且是可以在網上進行的在 http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/117890704/ABSTRACT。

ELA 用於比較無關的單個基因構成整理疾病關連的基因。 這個小組也開發了另一個途徑，使用一個兩階段關聯測試合併創建者的表現型，稱 TTFP，可能檢查的家庭成員染色體去生成。

「以前，研究員處理了核心家庭、父項和子項，但是這可能回到祖父項，曾祖父…早在您希望」。

這個小組在人類遺傳學歐洲日記帳上發布了他們的發現。 摘要是可用的在 http://www.nature.com/ejhg/journal/v15/n11/abs/5201902a.html。

即然他們開發了這個軟件，這個分析是相對地簡單的，說 Sha。 但是獲得基因數據運作不是。 「我們沒有數據集從事與」，她說，明顯地失敗。 「不是有醫學院的問題」。

http://www.mtu.edu/