Mathematicians di Michigan Technological University telah mengembangkan alat baru yang kuat untuk menampi keluar gen di balik beberapa penyakit manusia yang paling keras.
Dengan satu, mereka dapat melemparkan kembali melalui generasi untuk menentukan gen diwariskan belakang penyakit. Dengan lain, mereka telah mengisolasi 11 variasi dalam gen - disebut polimorfisme nukleotida tunggal, SNP atau "snips"-yang terkait dengan diabetes tipe 2.
"Dengan kronis, penyakit kompleks seperti Parkinson, diabetes dan [penyakit Lou Gehrig] ALS, beberapa gen yang terlibat," kata Qiuying Sha, asisten profesor ilmu matematika. "Anda membutuhkan pengujian kuat."
Bahwa tes adalah Ensemble Pendekatan Belajar (ELA), software yang dapat mendeteksi set SNP yang bersama-sama memiliki pengaruh signifikan terhadap penyakit.
Dengan kondisi mewarisi kompleks, termasuk diabetes tipe 2, gen tunggal dapat menimbulkan penyakit pada mereka sendiri, sementara gen lainnya menyebabkan penyakit ketika mereka bertindak bersama-sama. Di masa lalu, menemukan gen-gen ini kombinasi telah terutama berat, karena perhitungan yang diperlukan untuk menyesuaikan gen tersangka antara 500.000 atau lebih dalam genom manusia telah hampir mustahil.
ELA sidesteps masalah ini, pertama dengan drastis mempersempit bidang gen yang berpotensi berbahaya, dan kedua, dengan menerapkan metode statistik untuk menentukan SNP bertindak sendiri dan yang bertindak dalam kombinasi. "Kami pikir itu cukup keren," kata Sha.
Untuk menguji model mereka pada data riil, tim Sha menganalisis gen dari lebih dari 1.000 orang di Inggris, setengah dengan diabetes tipe 2 dan setengah tanpa. Mereka mengidentifikasi 11 SNP itu, tunggal atau berpasangan, terkait dengan penyakit dengan tingkat probabilitas yang tinggi. Karya mereka telah diterima oleh jurnal Epidemiologi dan Genetik tersedia online di http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/117890704/ABSTRACT .