Published on April 2, 2008 at 3:15 AM
在美國密歇根理工大學的數學家們開發出人類的一些最棘手的疾病背後的基因的風選功能強大的新工具。
有了之一,他們可以通過幾代人投回到找准繼承疾病背後的基因。與其他中,他們已經分離出11內基因的變化 - 稱為單核苷酸多態性,SNP位點或“剪”與 2型糖尿病。
“慢性,複雜的疾病如帕金森氏症,糖尿病和ALS的[盧伽雷氏病]的,涉及多個基因,說:”沙秋英,數學科學學院助理教授。 “你需要一個強大的考驗。”
該測試是集成學習方法(ELA),軟件,可以檢測出一組單核苷酸多態性,共同有一種疾病,療效顯著。
複雜的繼承的條件,包括2型糖尿病,單一基因可能會導致自己的疾病,而其他基因導致的疾病,當他們一起行動。在過去,發現這些基因的基因組合,特別是笨拙的,因為需要之間在人類基因組的50萬左右的犯罪嫌疑人的基因匹配的計算已經幾乎是不可能的。
ELA迴避這個問題,首先大幅縮小有潛在危險的基因的領域,並通過運用統計方法來確定 SNPs的行為對自己和行為結合第二,。 “我們認為這是很酷,”沙祖康說。
為了測試自己的真實數據模型沙的研究小組分析了從超過 1000人在英國,與 2型糖尿病和半無的一半基因。他們確定了11個 SNPs,單獨或成對出現的,是與高度的概率的疾病。他們的工作已被接受的遺傳流行病學“雜誌是在網上提供 http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/117890704/ABSTRACT 。
ELA是用來比較無關個體的遺傳構成,理清疾病相關的基因。該小組還開發了另一種方法,它採用了兩個階段協會的測試,結合創始人的表型,稱為 TTFP,可以研究可以追溯到幾代的家庭成員的基因組。
他說:“在過去,研究人員已經處理核的家庭,父母和子女,但是這可能回到祖父母,曾祖父母。 。 。早在你想要的。“
該小組已在歐洲人類遺傳學雜誌“發表了他們的研究結果。一個抽象的,是在可用 www.nature.com/ejhg/journal/v15/n11/abs/5201902a.html的。
沙說,現在,他們已經開發的軟件,分析比較簡單。但是的基因數據,工作不。 “我們沒有數據集工作,”她說,顯然感到沮喪。 “那有沒有學醫的問題。”
然而,那些數據集,可以使用團隊的軟件,以幫助找到事業和希望,治愈的疾病的盔甲。 ELA www.math.mtu.edu/〜數丈/ software.html ,TTFP要求提供在Windows和Linux版本。
http://www.mtu.edu/
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