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Nuovo portale web, la genomica strutturale PSI Knowledgebase per far avanzare gli studi di proteine

Published on April 4, 2008 at 7:29 AM · No Comments

L'iniziativa struttura delle proteine ​​(PSI), uno sforzo sostenuto dal National Institutes of Health (NIH), ha lanciato una risorsa online che permetteranno agli scienziati di diverse discipline biomediche di accedere facilmente a una grande quantità di informazioni su proteine ​​e per accelerare la scoperta di queste molecole .

Il nuovo portale, la genomica strutturale PSI Knowledgebase (PSI SGKB), è un punto di ingresso a tutte le strutture proteiche e le risorse produttiva creata dal PSI, un programma avviato nel 2000 per accertare le strutture tridimensionali di migliaia di proteine. Ad oggi, i centri di ricerca PSI hanno generato 2.800 strutture proteiche, e, nel processo, sviluppato delle tecniche che migliorano significativamente le fasi di determinazione della struttura.

"Molti di questi prodotti sono sempre stati disponibili, solo che non tutti nello stesso posto", ha detto Jeremy M. Berg, Ph.D., direttore del NIH, National Institute of General Medical Sciences, che supporta il PSI. "La capacità di ricercare le risorse sviluppate attraverso il PSI dovrebbe contribuire a una vasta gamma di scienziati farne uso per far avanzare i propri studi."

Il SGKB PSI è progettato principalmente per i biologi che, pur non essendo esperti di struttura delle proteine, potrebbe voler sapere di più su una particolare proteina legati alla loro ricerca nel campo della genetica, biochimica, farmacologia, la bioinformatica, la medicina clinica, o altre aree.

Dalla home page, i ricercatori possono inserire la sequenza di una proteina in una casella di ricerca per trovare rapidamente la corrispondente struttura e quelli come esso, oltre a informazioni sulla funzione e le relazioni su come le strutture sono stati generati. Un glossario di termini e acronimi aiuta a tradurre le informazioni.

Il sito è un gateway per altre informazioni utili, comprese le descrizioni di nuove tecnologie e metodi, un dettagliato elenco delle pubblicazioni principali risultati, possibilità di finanziamento integrativo per gli studi funzionali e collegamenti a risorse esterne del PSI. Utenti del sito possono anche facilmente accedere al PSI-Materiali Repository, una risorsa in via di sviluppo per l'ordinazione PSI-generato cloni in grado di accelerare gli studi di struttura e funzione delle proteine.