Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | العربية | Nederlands | Bahasa | Русский | Svenska | Polski

Model komputer baru ini membantu dinamika membran sel studi

Published on April 9, 2008 at 5:28 AM · No Comments

Sebuah sel membran cairan terus remodels untuk melaksanakan tugas-tugas penting, seperti mengenali sel lainnya, mendapatkan nutrisi atau menyortir protein.

Karena membran cairan dan intrinsik teratur, menyelidiki dan mendukung kehidupan secara detail proses selalu sulit. Tapi sebuah model komputer yang dikembangkan oleh Markus Deserno, profesor fisika di Carnegie Mellon University, menyediakan pendekatan baru dengan memungkinkan dia untuk mensimulasikan dan mengamati dinamika membran pada skala yang relatif besar - ratusan nanometer. Ini adalah pada skala ini bahwa banyak yang kritis membran-dimediasi proses berlangsung.

Deserno akan menjelaskan penerapan model ini untuk masalah biofisik penciptaan vesikel pada Selasa, 8 April pada pertemuan nasional 235 dari American Chemical Society di New Orleans.

"Model kami adalah kasar," kata Deserno. "Anda dapat menganggap itu sebagai sebuah lukisan impresionis. Di kejauhan, semuanya terlihat baik. Anda dapat melihat lili air atau balerina. Tapi dari dekat, semua rincian yang hilang, Anda hanya melihat bercak warna. Kami tertarik pada apa yang terjadi dengan bunga lili air, bukan bercak warna, "tambahnya.

Dengan model kasar, Deserno secara akurat dapat menangkap penting skala besar karakteristik, seperti bagaimana menekuk membran dan kurva, yang memungkinkan dia untuk mengajukan pertanyaan yang berada di luar resolusi atom tetapi kurang dari ukuran sel keseluruhan. Modelnya juga serbaguna karena ia dapat menambahkan protein menarik membran lipid dan mengamati bagaimana mereka berinteraksi.

Menggunakan model komputer, Deserno dan koleganya di Max Plank Institute for Polymer Research di Mainz, Jerman, baru-baru ini mengungkapkan mekanisme murni fisik yang memungkinkan vesiculation - ". Vesikula" proses di mana sel membran protein atau kurva di kargo selular lain untuk membentuk Tanpa kemampuan generik untuk protein kurva bertabur nya membran dan kuncup dari angkutan kargo, sel tidak bisa bertahan hidup.

"Pada akhirnya, memahami dinamika vesiculation adalah kunci untuk memajukan desain terapi anti-virus atau memahami bagaimana proses protein yang berjalan serba salah dalam sel dan menyebabkan penyakit," kata Deserno.