In het geval van een uitbarsting of een bioterroristaanval, is de snelle identificatie van de genetische veranderingen verantwoordelijk voor kwaadaardigheid of drugweerstand essentieel aan het opzetten van een efficiënte reactie.
Het Standaard rangschikken van DNA en de analyse van een ziekteverwekkergenoom zijn tijd-intensief en waarschijnlijk onpraktisch tijdens een noodsituatie. De Onderzoekers hebben nu een vergelijkende genomicastrategie ontwikkeld om de tijd drastisch te verminderen nodig om unieke genetische eigenschappen van een potentiële uitbarstingsspanning nauwkeurig te identificeren. Dit rapport, dat de benadering gebruikend volgende-generatie rangschikkend technologie aantoont, wordt gepubliceerd online vandaag in het Onderzoek van het Genoom (www.genome.org).
Het rangschikken van DNA van Sanger, de gevestigde die technologie wordt gebruikt om de genomen van vele species, met inbegrip van de genomen van mensen en honderden bacteriën te rangschikken, konden potentieel aan opeenvolging worden gebruikt en een nieuwe menselijke ziekteverwekker analyseren. Nochtans, is de tijd voor het rangschikken en verdere analyse, of „het eindigen wordt vereist,“ dusdanig dat deze benadering niet uitvoerbaar is wanneer een snelle reactie op een uitbarsting of een bioterroristaanval die wordt vereist. De Nieuwe het rangschikken technologieën zijn nu beschikbaar, toelatend een volledig bacterieel genoom om in verscheidene uren worden gerangschikt, maar de tijd-intensieve het eindigen stappen worden nog vereist om de volledige genoomopeenvolging te bepalen.
In deze die studie, onderzoekers door Drs. Bernard La Scola wordt geleid en Didier Raoult of trachtte de Universiteit van het Middellandse-Zeegebied te bepalen of een snel gerangschikt onvolledig genoom zou kunnen worden gebruikt om een uitbarstingsspanning door vergelijkende analyse snel te kenmerken. „In de context van een uitbarsting, kan een snelle benadering helpen om de genetische determinanten onmiddellijk te identificeren verantwoordelijk voor gewijzigde kwaadaardigheid of de transmissie, verklaart La Scola. Het „doel van dit werk was de onlangs beschikbare geautomatiseerde pyrosequencing technologie te evalueren zonder met deze bedoeling het eindigen.“