Sa kaganapan ng isang silakbo o isang atake ng bioterrorist, mabilis na pagkilala ng genetic pagbabago na responsable para sa poot o gamot panlaban ay mahalaga sa kabitan ng isang epektibong tugon.
Standard DNA sequencing at pagtatasa ng isang pathogen genome ay time-intensive at malamang na walang paraan sa panahon ng isang emergency. Mga mga mananaliksik ay may ngayon nakabuo ng isang comparative genomics diskarte sa husto na bawasan ang oras na kinakailangan na tumpak na makilala ang mga natatanging genetic katangian ng isang potensyal na pilay pagsiklab. Ang ulat na ito, na kung saan nagpapakita ang diskarte sa pag-gamit ng kasunod na henerasyon na teknolohiya ng sequencing, ay na-publish ng online na ngayon sa Genome Research (www.genome.org).
Sanger DNA sequencing, ang itinatag na teknolohiya na ginagamit upang sequence ang mga genomes ng maraming mga species, kabilang ang mga genomes ng mga tao at mga daan-daang mga mga bakterya, ay maaaring potensyal na magamit sa pagkakasunod-sunod at pag-aralan ang isang bagong tao pathogen. Gayunpaman, ang oras na kinakailangan para sa sequencing at kasunod na pagsusuri, o "pagtatapos," ay tulad na ang diskarte na ito ay hindi magagawa kapag ang isang mabilis na tugon sa isang silakbo o bioterrorist atake ay kinakailangan. Bagong sequencing teknolohiya ay magagamit na ngayon, na nagpapahintulot sa isang buong bacterial genome sa sequenced sa ilang oras, ngunit ang mga time-intensive pagtatapos ng mga hakbang pa rin ang kinakailangan upang matukoy ang kumpletong genome sequence.
Sa pag-aaral na ito, ang mga mananaliksik ay humantong sa pamamagitan ng Drs. Bernard La Scola at Didier Raoult ng Unibersidad ng Mediterranean set out upang matukoy kung ang isang mabilis sequenced kumpleto genome ay maaaring gamitin upang mabilis na makilala ang isang pilay ng pagsiklab ng comparative analysis. "Sa konteksto ng isang pagsilakbo, ang isang mabilis na diskarte ay maaaring makatulong upang makilala agad ang genetic determinants na responsable para sa nabago poot o paghahatid, nagpapaliwanag La Scola. "Ang layunin ng trabaho na ito ay upang suriin ang kamakailan magagamit automated pyrosequencing teknolohiya nang hindi pagtatapos para sa layunin na ito."