Im Falle eines Ausbruchs oder eines Bioterroristangriffs ist schnelles Kennzeichen der genetischen Änderungen, die für Giftigkeit verantwortlich sind oder Medikamentenresistenz zum Montieren einer effektiven Antwort wesentlich.
StandardDNA-Sequenzierung und Analyse eines Krankheitserregergenoms ist und wahrscheinlich nicht durchführbar während eines Notfalls zeit-steigernd. Forscher haben jetzt eine vergleichbare Genomicsstrategie entwickelt, um die Zeit drastisch zu verringern, die, um eindeutige genetische Eigenschaften einer möglichen Ausbruchspannung genau zu kennzeichnen erforderlich ist. Dieser Bericht, der den Anflug unter Verwendung der zukünftigen Sequenziertechnik zeigt, wird Onlineheutiger tag in der Genom-Forschung (www.genome.org) veröffentlicht.
Sanger-DNA-Sequenzierung, die festgelegte Technologie, die eingesetzt wurde, um die Genome vieler Spezies, einschließlich die Genome von Menschen und die Hunderte von den Bakterien sequenziell zu ordnen, konnte möglicherweise verwendet werden, um ein neues Humanpathogen sequenziell zu ordnen und zu analysieren. Jedoch ist die Zeit, die für das Sequenziell ordnen und nachfolgende Analyse oder „die Fertigung benötigt wird,“ so, dass dieser Anflug nicht durchführbar ist, wenn eine schnelle Antwort zu einem Ausbruch- oder Bioterroristangriff gefordert wird. Neue Sequenziertechniken sind jetzt erhältlich und erlauben, dass ein gesamtes bakterielles Genom in einige Stunden sequenziell geordnet wird, aber zeit-steigernde Fertigstellungsschritte werden noch gefordert, die komplette Genomreihenfolge zu bestimmen.
In dieser Studie Forscher geführt durch TEA. Bernard-La Scola und Didier Raoult der Universität vom Mittelmeer dargelegt, um zu bestimmen, ob ein schnell sequenziell geordnetes unvollständiges Genom, um eine Ausbruchspannung schnell zu kennzeichnen durch Analyse mit Vergleichswerten verwendet werden könnte. „Im Rahmen eines Ausbruchs, hilft möglicherweise ein schneller Anflug, die genetischen bestimmenden Faktoren sofort zu kennzeichnen, die für geänderte Giftigkeit verantwortlich sind, oder Übertragung, erklärt La Scola. „Das Ziel dieser Arbeit war, die vor kurzem erhältliche automatisierte pyrosequencing Technologie auszuwerten, ohne zu diesem Zweck zu beenden.“