No caso de uma manifestação ou de um ataque do bioterrorista, a identificação rápida das mudanças genéticas responsáveis para a virulência ou a resistência de droga é essencial a montar uma resposta eficaz.
Arranjar em seqüência do ADN e análise Padrão de um genoma do micróbio patogénico são tempo-intensivos e provavelmente pouco prático durante uma emergência. Os Pesquisadores têm desenvolvido agora uma estratégia comparativa da genómica para reduzir dràstica o tempo necessário para identificar exactamente propriedades genéticas originais de uma tensão potencial da manifestação. Este relatório, que demonstra a aproximação usando a próxima geração que arranja em seqüência a tecnologia, é publicado hoje em linha na Pesquisa do Genoma (www.genome.org).
Arranjar em seqüência do ADN de Sanger, a tecnologia estabelecida usada para arranjar em seqüência os genomas de muitas espécies, incluindo os genomas dos seres humanos e centenas de bactérias, podiam potencial ser usadas para arranjar em seqüência e analisar um micróbio patogénico humano novo. Contudo, o tempo exigido para arranjar em seqüência e análise subseqüente, ou “terminação,” é tal que esta aproximação não é praticável quando uma resposta rápida a um ataque da manifestação ou do bioterrorista é exigida. As tecnologias arranjando em seqüência Novas estão agora disponíveis, permitindo que um genoma bacteriano inteiro seja arranjado em seqüência em diversas horas, mas as etapas tempo-intensivas do revestimento são exigidas ainda determinar a seqüência completa do genoma.
Neste estudo, pesquisadores conduzidos pelo Afastamento Cilindro/rolo. La Scola e Didier Raoult de Bernard da Universidade do Mediterrâneo expor para determinar se um genoma incompleto ràpida arranjado em seqüência poderia ser usado para caracterizar rapidamente uma tensão da manifestação pela análise comparativa. “No contexto de uma manifestação, uma aproximação rápida pode ajudar a identificar imediatamente as causas determinantes genéticas responsáveis para a virulência alterada ou a transmissão, explica o La Scola. “O alvo deste trabalho era avaliar a tecnologia pyrosequencing automatizada recentemente disponível sem terminar com esta finalidade.”