В случае вспышки или нападения bioterrorist, быстрое идентификация генетических изменений ответственных для вирулентности или сопротивления снадобья необходимо к устанавливать эффективную реакцию.
Стандартные sequencing ДНА и анализ генома патогена врем-интенсивнейши и вероятно непрактично во время аварийной ситуации. Исследователя теперь начинали сравнительную стратегию геномики drastically для того чтобы уменьшить время необходимое точно для того чтобы определить уникально генетические свойства потенциального напряжения вспышки. Этот рапорт, который демонстрирует подход используя следующее поколени sequencing технология, опубликован он-лайн сегодня в Исследовании Генома (www.genome.org).
Sequencing ДНА Sanger, установленная технология используемая для того чтобы sequence геномы много видов, включая геномы людей и сотниы бактерий, смогли потенциально быть использованы для того чтобы sequence и проанализировать новый людской патоген. Однако, время необходимо для sequencing и последующий анализа, или «заканчивать,» такое что этот подход не возможн когда необходима быстрая реакция к нападению вспышки или bioterrorist. Новые sequencing технологии теперь доступны, позволяющ всему бактериальному геному быть sequenced в нескольких часов, но необходимы, что определяют врем-интенсивнейшие шаги отделкой все еще полную последовательность генома.
В этом изучении, исследователя водить Drs. Ла Scola и Didier Raoult Бернарда Университета Среднеземноморского комплекта вне для того чтобы определить смог ли быстро sequenced неполный геном быть использован быстро для того чтобы характеризовать напряжение вспышки сравнительным анализом. «В контексте вспышки, быстрый подход может помочь определить немедленно генетические определители ответственные для доработанной вирулентности или передача, объясняет Ла Scola. «Цель этой работы была оценить недавно доступную автоматизированную pyrosequencing технологию без заканчивать в этой цели.»