新的方法迅速地描述与下一代脱氧核糖核酸排序的爆发张力

在爆发或生物恐怖分子攻击情形下，基因更改的迅速确定负责对剧毒或药物抗性对挂接有效回应是重要的。

对病原生物染色体的标准脱氧核糖核酸排序和分析是定期密集的和可能不切实际在紧急期间。 研究员现在开发一个比较染色体组的方法激烈地减少需要的时间准确地识别潜在的爆发张力的唯一基因属性。 此报表，使用下一代排序的技术，展示途径，被发布在染色体研究 (www.genome.org) 的在线今天。

Sanger 脱氧核糖核酸排序，用于的被设立的技术排序许多种类染色体，包括人染色体和数百细菌，能可能地用于排序和分析新的人力病原生物。 然而，为排序和随后的分析或者 “完成的需时”，是这样此途径不是可行的，当需要时对爆发或生物恐怖分子攻击的一种迅速回应。 新的排序的技术现在是可用的，允许一条整个细菌染色体在几时数排序，但是仍然要求定期密集完成步骤确定完全染色体顺序。

在此研究中， Drs 导致的研究员。 大学的 Bernard La Scola 和迪迪埃地中海开始的 Raoult 确定一条迅速地排序的未完成染色体是否可能由比较分析用于迅速分析爆发张力。 “在爆发中，一个快速途径可能帮助立即识别基因定列式负责对被修改的剧毒或传输，解释 La Scola。 “此工作的目标将评估最近可用的自动化的 pyrosequencing 的技术没有为此完成”。

F. tularensis，土拉菌病的引起病原生物，是已知的其中一最感染的细菌，并且有特别事情此有机体可能被操作为使用作为生物武器。 La Scola 和同事排序与土拉菌病患者查出的张力使用排序系统的 Roche/454 生命科学 GS20，并且这些顺序与 F. tularensis 比较几其他张力，包括与减少的 pathogencity 和 antiobiotic 抗性张力的张力。

研究员显示出，下一代排序没有完成的一条细菌染色体可能用于几星期有效识别 F. tularensis 临床张力的几个唯一功能。 通过使用此方法， “，如果有研究这个项目的 bioinformaticians 的一个满足的编号，对对这条染色体的完整分析的脱氧核糖核酸提取可能需要大约 6 个星期”，描述 La Scola。 “我们显示出，此方法是高效检测基因多形性例如基因修改负责对抗药性阻力和基因损失”。 此外， La Scola 和同事能与 F. tularensis 其他 80 张力区分临床张力。

当高处理量排序技术的和在此工作概述的比较基因组分析策略显著减少了为爆发张力的描述特性时的需时， La Scola 注意到，在软件的远期预付款顺序数据分析和染色体比较的可能加速处理甚而促进。

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