Een dichtere alliantie tussen computer en experimentele onderzoekers is nodig om vooruitgang tegen één van opwindendste doelstellingen van de biologie te boeken de, begrijpend hoe de epigenetische tekens tot regelgeving van genuitdrukking bijdragen.
Dit kwam uit een recente die workshop te voorschijn door de Europese Stichting van de Wetenschap wordt georganiseerd (ESF), „ComputerBenaderingen van de Rol van Epigenetische Tekens in de Verordening van de Transcriptie“.
Epigenetics bestudeert eigenschappen van DNA en chromatin die stabiel door celafdeling worden geërft maar die voorbij de opeenvolging van DNA zelf zijn. Het is reeds lang gevestigd geweest dat de epigenetische eigenschappen het transcriptieproces beïnvloeden waardoor de opeenvolgingen van DNA van genen in RNA en de eiwitproducten vertaald zijn die structuur en functie bepalen. Enkel zoals cruciaal, men gelooft dat epigenetics ook veranderingen in deze patronen van de genuitdrukking om toelaat worden herinnerd, zodat de verschillende organen en de weefsels tijdens embryonale ontwikkeling kunnen te voorschijn komen, en hun identiteit en functie voor de rest van het leven van het organisme behouden.
De Veranderingen in genuitdrukking kunnen uit het wijzigen van chromatin voortvloeien, die de structuur die uit proteïnen en DNA bestaan is die de bewaarplaats voor genetische informatie is. De Tekens worden opgelegd die als malplaatjes voor wijziging van chromatin dienen, die de capaciteit van genen die door de de transcriptiemachines van DNA moeten worden betreden veranderen. Het resultaat is dat sommige genen worden onderdrukt en anderen worden totaal tot zwijgen gebracht. Één van de belangrijkste die vragen op de workshop van ESF worden besproken betrof hoe deze veranderingen tijdens celafdeling door replicatie van de epigenetische tekens „worden herinnerd“, en toch hoe in sommige gevallen deze kunnen worden omgekeerd, toelatend een cel om worden geherprogrammeerd zodat het een verschillende rol of een functie kan overnemen.
De capaciteit van cellen die door het hebben van epigenetische verwijderde tekens moeten worden geherprogrammeerd is van duidelijk belangstelling en belang in het onderzoek van de stamcel, bovengenoemde Erik van Nimwegen van Universiteit van Bazel in Zwitserland, convenor van de workshop van ESF. In sommige gevallen kunnen de cellen „op deze wijze DE- wordenonderscheiden“, verliezend hun normale functie en wordend opnieuw stamcellen, geschikt om later in verschillende celtypes te verdelen door nogmaals aangewezen controles over uitdrukking van hun genen te verwerven.
De capaciteit om epigenetische tekens te verliezen evenal te bereiken die de uitdrukking van bepaalde genen beperken is ook belangrijk in vroege embryonale ontwikkeling, wanneer de snelle veranderingen in structuur en functie zich voordoen. Één presentatie op de workshop door Zeemansdolk Schübeler van Friedrich Miescher Institute in Bazel beschreef hoe de gehele reeksen genen hun die uitdrukking kunnen hebben enkel tijdelijk door het proces van methylation van DNA, één wordt gewijzigd van de belangrijkste mechanismen om toegang tot onderliggende DNA van een gen te blokkeren.
Maar met zo veel nog legt dat over de complexe en subtiele aard van genregelgeving door epigenetische wijziging moet worden ontdekt, de grootste triomf van de workshop van ESF niet zodat veel in de individuele presentaties, maar de collectieve besluiten over toekomstige die onderzoekprioriteiten, en de verhoudingen tussen computer en experimentele biologen worden gevestigd.
„Wij denken dat de besprekingen onder experimentalists en theoretici betreffende interesserende onopgeloste vragen de planning voor toekomstig onderzoek van alle deelnemers,“ bovengenoemde bestelwagen Nimwegen gestalte heeft gegeven. „Verscheidene deelnemers vonden de workshop eerder uniek was in zoverre dat het een grote verscheidenheid van onderzoekers samenbracht die op een gebied werken dat.“ eerder nieuw is
De Experimenten en de observatie verstrekken de gegevens over de patronen van de genuitdrukking, terwijl de computermethodes de veranderingen in tijd analyseren en de hulp opeenvolgingen identificeert die in feite zijn onthouden, en anderen die „zijn vergeten“. Dit fenomeen waardoor de cellen in feite herinneren wat aan hen is gebeurd en antwoordt door veranderingen in hun uitdrukking is fundamenteel voor ontwikkeling van organismen, samen met hun structuur en functie tijdens hun leven, evenals overerving van aanpassingen aan milieufactoren.
http://www.esf.org/