Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Русский | Svenska | Polski

Вычислительные подходы к роли эпигеномных меток в регулировке транскрипции

Published on April 11, 2008 at 6:33 AM · No Comments

Более близкое союзничество между вычислительными и экспириментально исследователями необходимо для того чтобы сделать прогресс к одной из целей биологии самых трудных, понимающ как эпигеномные метки внести вклад в регулировка выражения гена.

Это вытекло от недавней мастерской организованной Европейским Учредительством Науки (ESF), «Вычислительные Подходы к Роли Эпигеномных Меток в Регулировке Транскрипции».

Epigenetics изучают характеристики ДНА и хроматин которые стабилизированно унаследованы через разделение клетки но которое за последовательностью самой ДНА. Она солидна что эпигеномные характеристики влияют на процесс транскрипции whereby последовательности ДНА генов переведены в продукты РИБОНУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ и протеина которые определяют структуру и функцию. Как Раз как критически, поверено что epigenetics также позволяет изменениям к этим картинам выражения гена быть вспомненным, так, что различные органы и ткани смогут вытечь во время зародышевого развития, и сохраняет их тождественность и функцию для остальноев продолжительности жизни организма.

Изменения в выражении гена могут привести к от дорабатывая хроматина, который структура состоя из протеинов и ДНА которое архив для генетической информации. Наведены Метки которые служят как шаблоны для изменения хроматина, изменяющ способность генов быть достиганным машинным оборудованием транскрипции ДНА. Результат что некоторые гены подавлены и другие заставлены замолчать вполне. Один из ключевых вопросов обсуженных на мастерской ESF обеспокоенной как эти изменения «вспомнены» во время разделения клетки через репликацию эпигеномных меток, или/и как в некоторые случаи эти можно обратить, позволяющ клетке быть перепрограммированным так, что она сможет принять на различные роль или функцию.

Способность клеток быть перепрограммированным путем иметь эпигеномные метки извлечься представил интерес большой интерес и важность в исследовании стволовой клетки, сказала Эрик фургон Nimwegen от Университета Базеля в Швейцарии, convenor мастерской ESF. В клетки некоторых случаев можно «de-продифференцировать» в этом путе, терять их нормальную функцию и становить стволовые клетки снова, способно затем разделять в различные типы клетки путем приобретать еще раз соотвествующее управление над выражением их генов.

Способность потерять так же, как приобрести эпигеномные метки которые ограничивают выражение некоторых генов также важны в предыдущем зародышевом развитии, когда изменения речного порога в структуре и функции происходят. Одно представление на мастерской Dirk Schübeler Института Friedrich Miescher в Базеле описало как все комплекты генов могут иметь их выражение доработанное как раз временно через процесс метилирования ДНА, один из главным образом механизмов для преграждать доступ к основному ДНА гена.

Но с так много все еще быть открынным о сложной и тонкой природе регулировки гена через эпигеномное изменение, большой триумф мастерской ESF кладет не так много в индивидуальные представления, но собирательные решения над будущими приоритетами исследования, и отношения установленные между вычислительными и экспириментально биологами.

«Мы думаем что обсуждения среди experimentalists и теоретиков относительно интересных выдающих вопросов сформировали запланирование для будущего исследования всех участников,» сказали фургон Nimwegen. «Несколько участников чувствовали что мастерская была довольно уникально в что она принесла совместно большое разнообразие исследователей работая в поле которое довольно ново.»

Эксперименты и замечание обеспечивают данные о картинах выражения гена, пока вычислительные методы анализируют изменения над временем и помогают определить последовательности которые в запомненном влиянии, и других которые «были забыты». Это явление whereby клетки в влиянии вспоминают что случалось к им и отвечает через изменения в их выражении основно к развитию организмов, вместе с их структурой и функцией во время их продолжительности жизни, так же, как унаследование приспособлений к экологическим факторам.

http://www.esf.org/