De kaarten van het geheel-Orgaan die genetische informatie over het terrein van kankerblazen toevoegen brengen de moleculaire reis van normale cel aan invasieve kanker in kaart, wordt geleid rapporteert een internationaal die onderzoeksteam door wetenschappers bij de Universiteit van het Centrum van Kanker van Texas M.D. Anderson online bij het Onderzoek van het dagboekLaboratorium.
Door de gevarieerde normaal, precancerous en kwaadaardige weefsels van een orgaan - - met hun onderliggende genetische variatie of regelgeving geografisch met elkaar in verband te brengen, identificeerde het team ook een essentiële nieuwe categorie van genen die het proces van kankerontwikkeling lanceert.
„Deze „voorlopergenen“ zijn de contactsleutel die de motor van carcinogenese,“ bovengenoemde hogere auteur Bogdan Czerniak, M.D., Ph.D., professor in het Ministerie van M.D. Anderson van Pathologie begint.
De „Ontdekking van voorlopergenen opent een volledig nieuw gebied van onderzoek om biomarkers voor de vroege opsporing en de preventie van kanker te identificeren,“ bovengenoemde Czerniak. De „Inactivering van deze genen komt tijdens het onzichtbare stadium van kanker voor, wanneer het door traditionele middelen.“ niet op te sporen is
Het team rapporteert dat de voorlopergenen moeten zijn gesloten alvorens een belangrijk tumor-onderdrukkend gen RB1 wordt tot zwijgen gebracht riep, banend de weg voor invasieve kanker. Door de genetische aspecten van alle weefseltypes in het orgaan te kenmerken, verlichtten de onderzoekers de opeenvolging van gebeurtenissen die een normale cel door diverse stadia aan invasieve kanker vervoert. In het geval van blaaskanker, identificeerden zij drie „golven“ van genetische klappen die het proces aansturen.
Wordt de unieke benadering van Czerniak genoemd gehele orgaan histologische en genetische afbeelding, die genetische informatie met microscopische studie van het orgaanweefsel, of histologie combineert.
Biomarkers voor opsporing, preventie, behandeling
De de afbeeldingstechnieken van Czerniak en de bevindingen van het team zijn het rudimentaire werk, bovengenoemd T. Sudhir Srivastava, Ph.D., leider van het Onderzoeksteam van Biomarkers van Kanker, Afdeling van de Preventie van Kanker van het Nationale Instituut van Kanker.
„Het Identificeren van genen betrokken bij precancerous ontwikkeling is een lastige taak, hoofdzakelijk bij gebrek aan een systematische benadering van het ontdekken van hen en het niet beschikbaar zijn van de specimens van de kwaliteitstumor geweest,“ bovengenoemde Srivastava. „Dr. Czerniak heeft deze moeilijkheden door de middelen te gebruiken beschikbaar bij M.D. Anderson en de gen-in kaart brengende deskundigheid van zijn groep aan te wenden om chromosomale gebieden uniek te kenmerken betrokken bij genomic onevenwichtigheid overwonnen, in het bijzonder die betrokken bij vooruitgang van precancerous voorwaarden aan klinisch agressieve blaaskanker.
„Deze bevindingen zullen de ontwikkeling van klinisch nuttige biomarkers voor de vroege opsporing, het toezicht, en het klinische beheer van blaaskanker,“ bovengenoemde Srivastava versnellen, die het Netwerk van het Onderzoek van de Vroege Opsporing van NCI leidt, dat gedeeltelijk het werk van Czerniak financiert.
Kanker van de Blaas is vijfde gemeenschappelijkste kanker in de Verenigde Staten en geeft jaarlijks rekenschap van 3 percent van kankersterfgevallen. Het wordt sterk geassocieerd met het roken, die bestudeert toont een factor in de helft gevallen is
Het onderzoekmodel kan worden gebruikt om andere kanker van het epithelium te bestuderen -- het weefsel dat lijnen de oppervlakten en de holten van de organen van het lichaam. Epitheliaale kanker, of de carcinomen, maken omhoog 80 percent van alle kanker.
De onderzoekers rapporteren dat de tot zwijgen gebrachte voorlopergenen betrokken bij vroege ontwikkeling van blaaskanker ook in verschillende mate in long, borst, bloed en gemeenschappelijke pediatrische malignancies tot zwijgen worden gebracht.
De Kaart leidt manier tot zes chromosomale gebieden
Het 29 paginadocument, dat multi-step genetisch onderzoek, bevestigingsstudies van aanvankelijke bevindingen, studies van genuitdrukking behandelt, gen het rangschikken en een regelgevend die proces als methylation wordt bekend, functionele studies van kandidaatgenen en epidemiologische analyse, neemt de helft van de ruimte van het Onderzoek van het Laboratorium voor origineel onderzoek naar zijn kwestie van Juli op.
„Wij hebben fundamenteel leeggehaald de kwestie voor dit document,“ zei de redacteur van het dagboek, James M. Crawford, M.D., Ph.D., de professor en de stoel van de Universiteit van de Universiteit van Florida van het Ministerie van de Geneeskunde van Pathologie, Immunologie en de Geneeskunde van het Laboratorium. Het Wijden dat veel ruimte aan één enkel document hoogst ongebruikelijk is, maar Crawford is overtuigd het lonend is. Een „persoon zou dit document moeten kunnen lezen en dit volledige, belangrijke verhaal kennen,“ bovengenoemde Crawford.
Het document documenteert drie golven van genetische klappen, hoofdzakelijk implicerend genetische schrappingen, die cellen van normale aan precancerous staten drijven. De eerste golf leidt tot wijdverspreide uitbreiding van urothelial cellen dat de haven genetische veranderingen maar anders onder microscopische analyse normaal lijken.
De tweede golf verstrekt een de groeivoordeel aan cellen die nu herkenbare uitgaande eigenschappen van dysplasie - precancerous cellulaire abnormaliteiten hebben. De derde golf zet volledig de verschijning van de cel om en kenmerkt het begin van strenge dysplasie of carcinoomkanker in situ, niet-invasieve die nog tot zijn weefsel van oorsprong wordt beperkt, in dit geval urothelium. Carcinoom in situ en dysplasievooruitgang aan invasieve kanker.
Het team bracht het weefsel van vijf kankerblazen in kaart. Daarna, wendden zij 787 tellers van DNA aan om chromosomale gebieden te identificeren die genetische schrappingen tonen. Door de laag-resolutiekaart van genetische variatie over de geografische kaart van het weefsel dat van het orgaan toe te voegen, identificeerden zij gebieden met zowel eerste-golf als tweede-golfcellen worden geassocieerd.
De Extra analyse versmalde de chromosomale gebieden aan gedeelten van zes chromosomen. Deze zes plaatsen werden bevestigd door veelvoudige tellers van genetisch verlies in die chromosomale gebieden in de urine en het bloed van 32 patiënten van blaaskanker en 31 gezonde patiënten met een geschiedenis van blaaskanker te testen. De Genetische verliezen van minstens één van de zes gebieden werden gevonden in het percent van 98 van patiënten. In het percent van 82 van de gevallen, waren twee tot vijf chromosomale gebieden geïmpliceerd.
De Tot Zwijgen Gebrachte voorlopers verstikken een tumor-ontstoringsapparaat
Het team koos het gebied 13q14 op chromosoom 13, dat zij wisten het tumor-ontstoringsapparaat RB1, voor high-resolution genetische analyse harbored om kandidaatgenen te identificeren beïnvloedend RB1 door enig-nucleotidepolymorfisme als (SNPs) tellers te gebruiken. SNPs is punten in het genoom die door één enkele bouwsteen of het nucleotide van DNA chemische variëren.
Zij onderzochten 92 SNPs in kaart brengend aan een gebied rond het RB1 gen in 84 in paren gerangschikte steekproeven van blaastumors en bloedDNA. Deze high-resolution genetische analyse richtte aan de zelfde sectie van het chromosoom dat de gehele orgaan histologische en genetische afbeelding met uitbreiding van abnormale cellen had geïdentificeerd.
Twee genen in het gebied werden gevonden om cellen een eerste minimum genetisch voordeel te geven nodig om in kanker te groeien.
Een naburig gen genoemd werd ITM2B gevonden om door methylation worden tot zwijgen gebracht, die de aansluting van een methyl chemische groep aan gedeelten van het gen is dat het sluit. In de tumors van blaaskanker en kankercellenvariëteiten, werd dit gen geméthyleerd 40 percent van de tijd.
Een gen als P2RY5 wordt binnen een gedeelte van het RB1 gen wordt gevestigd bekend werd beïnvloed door een aantal enig-nucleotideveranderingen die. Werd een geval-controle studie van één van de verschillende vormen van het gen uitgevoerd gebruikend bloedDNA van 790 patiënten van blaaskanker en 712 die controles voor leeftijd en geslacht worden aangepast. De specifieke variatie was aanwezig in 2.78 percent van patiënten en elke patiënt met de variatie die ook ontwikkelde blaaskanker rookte.
De voorlopergenen in blaaskanker worden werden geanalyseerd voor hun uitdrukking, methylation en opeenvolging in 62 die cellenvariëteiten uit belangrijke groepen gemeenschappelijke kanker worden afgeleid geïdentificeerd die. Van de geteste cellenvariëteiten, werd de uitdrukking van het voorlopergen verminderd in 63 percent van de gevallen en ITM2B werd geméthyleerd in 42 percenten.
Terwijl de voorlopergenen downregulated in long waren, borst, bloed en pediatrische malignancies, werden zij sterk uitgedrukt in dubbelpunt en leverkanker. Dit houdt, de onderzoekersnota steek, omdat die twee kanker zich niet op inactivering van RB1 baseren te bloeien.
Het Onderzoek gaat verder. „Het nam ons 10 jaar om te krijgen waar wij nu zijn. Met de nieuwe nu beschikbare hoog-productietechnologie, zullen wij een high-resolution genetische kaart van het volledige genoom voor blaaskanker in de volgende twee of drie jaar voltooien,“ bovengenoemde Czerniak.
http://www.mdanderson.org/