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l'indagine genomica dell'Intero-Organo descrive il viaggio da normale alla cella maligna

Published on May 5, 2008 at 6:33 PM · No Comments

le mappe dell'Intero-Organo che sovrappongono le informazioni genetiche sopra il terreno delle vesciche cancerogene tracciano una carta del viaggio molecolare dalla cella normale a tumore invasivo, un gruppo di ricerca internazionale piombo dagli scienziati Ai rapporti del Centro del Cancro dell'Università del Texas il M. il D. Anderson online alla Ricerca del Laboratorio del giornale.

Geograficamente collegando i tessuti diversi di un organo - normali, precancerosi e maligni - alla loro variazione o regolamento genetica di fondo, il gruppo egualmente ha identificato una nuova categoria cruciale di geni che lancia il trattamento dello sviluppo del cancro.

“Questo “precursore che i geni„ sono il tasto di infiammazione che avvia il motore di carcinogenesi,„ ha detto l'autore senior Bogdan Czerniak, M.D., il Ph.D., il professor nel Dipartimento del M. il D. Anderson di Patologia.

“La Scoperta dei geni del precursore apre un assolutamente nuovo campo di ricerca per identificare i biomarcatori per l'individuazione tempestiva e prevenzione di cancro,„ Czerniak ha detto. “L'Inattivazione di questi geni si presenta durante la fase invisibile del cancro, quando è inosservabile attraverso i mezzi tradizionali.„

Il gruppo riferisce che i geni del precursore devono essere interrotti prima che un gene disoppressione importante chiamato RB1 sia fatto tacere, aprente la strada per tumore invasivo. Caratterizzando gli aspetti genetici di tutto il tessuto digita dentro l'organo, i ricercatori ha illuminato la serie di eventi che porta una cella normale attraverso le varie fasi a tumore invasivo. Nel caso del cancro di vescica, hanno identificato tre “onde„ dei colpi genetici che determinano il trattamento.

L'approccio unico di Czerniak è chiamato mappatura istologica e genetica dell'intero organo, che riunisce le informazioni genetiche con lo studio microscopico del tessuto dell'organo, o l'istologia.

Biomarcatori per rilevazione, prevenzione, trattamento

Le tecniche di mappatura di Czerniak ed i risultati del gruppo sono lavoro seminale, hanno detto T. Sudhir Srivastava, il Ph.D., il capo del Gruppo Di Ricerca Di Biomarcatori del Cancro, Divisione di Prevenzione del Cancro dell'Istituto Nazionale contro il Cancro.

“Identificare i geni in questione nello sviluppo precanceroso è stata un compito arduo, soprattutto in mancanza di approccio sistematico a scoprire loro e la indisponibilità degli esemplari del tumore di qualità,„ Srivastava ha detto. “Il Dott. Czerniak ha superato queste difficoltà utilizzando le risorse disponibili al M. il D. Anderson ed impiegando la competenza dimappatura del suo gruppo per caratterizzare unicamente le regioni cromosomiche coinvolgere negli squilibri genomica, specialmente quelli coinvolgere nella progressione delle circostanze precancerose al cancro di vescica clinicamente aggressivo.

“Questi risultati accelereranno lo sviluppo dei biomarcatori clinicamente utili per l'individuazione tempestiva, sorveglianza e gestione clinica del cancro di vescica,„ ha detto Srivastava, che piombo la Rete della Ricerca dell'Individuazione Tempestiva del NSC, che parzialmente costituisce un fondo per il lavoro di Czerniak.

Il cancro di Vescica è il quinto la maggior parte del cancro comune negli Stati Uniti e rappresenta 3 per cento delle morti del cancro annualmente. È associato forte con il fumo, che studia la manifestazione è un fattore a metà dei casi

Il modello della ricerca può essere usato per studiare altri cancri dell'epitelio -- il tessuto che allinea le superfici e le intercapedini degli organi dell'organismo. I cancri Epiteliali, o i carcinoma, compongono 80 per cento di tutti i cancri.

I ricercatori riferiscono che i geni fatti tacere del precursore in questione nello sviluppo iniziale del cancro di vescica egualmente sono fatti tacere a vari gradi in polmone, in petto, nel sangue e nelle malignità pediatriche comuni.

La Mappa piombo il modo a sei regioni cromosomiche

La pagina 29 di carta, che riguarda la selezione genetica a più gradi, studi di convalida sui risultati iniziali, studi su espressione genica, ordinamento del gene e un trattamento regolatore conosciuto come metilazione, studi funzionali dei geni del candidato e l'analisi epidemiologica, prende la metà dello spazio della Ricerca del Laboratorio per la ricerca originale nella sua emissione di Luglio.

“Abbiamo cambiato aria basicamente l'emissione per questo documento,„ ha detto l'editore di riviste, il James il M. Crawford, il M.D., il Ph.D., il professor e la presidenza dell'Università di Istituto Universitario di Florida del Dipartimento della Medicina di Patologia, dell'Immunologia e della Medicina del Laboratorio. Sta Dedicando che molto spazio ad un singolo documento è altamente insolito, ma Crawford gli è convinto che proficuo. “Una persona dovrebbe potere leggere questo documento e conoscere questa intera, storia importante,„ Crawford ha detto.

I documenti cartacei tre onde dei colpi genetici, pricipalmente comprendenti le eliminazioni genetiche, che determinano le celle da normale agli stati precancerosi. La prima onda piombo ad espansione diffusa delle celle urothelial che harbor i cambiamenti genetici ma altrimenti sembra normale nell'ambito di analisi al microscopio.

La seconda onda fornisce un vantaggio della crescita alle celle che ora hanno funzionalità esterne riconoscibili di displasia - le anomalie cellulari precancerose. La terza onda completamente trasforma l'aspetto delle cellule e caratterizza l'inizio di displasia o di tumore in situ severa, cancro non invadente ancora limitato al suo tessuto dell'origine, in questo caso il urothelium. Il Tumore in situ e la displasia avanzano a tumore invasivo.

Il gruppo ha mappato il tessuto di cinque vesciche cancerogene. Dopo, hanno impiegato 787 indicatori del DNA per identificare le regioni cromosomiche che video le eliminazioni genetiche. Sovrapponendo la mappa di basso risoluzione della variazione genetica sopra la mappa geografica del tessuto dell'organo, hanno identificato le regioni connesse con sia primo Wave che le celle di secondo Wave.

L'analisi Supplementare ha limitato le regioni cromosomiche alle parti di sei cromosomi. Questi sei siti sono stati confermati provando gli indicatori multipli di perdita genetica in quelle regioni cromosomiche nell'urina e nel sangue di 32 malati di cancro della vescica e di 31 paziente sano con una cronologia del cancro di vescica. Le perdite Genetiche almeno da una delle sei regioni sono state trovate in 98 per cento dei pazienti. In 82 per cento dei casi, due - cinque regioni cromosomiche erano implicate.

I precursori Fatti Tacere soffocano un tumore-soppressore

Il gruppo ha scelto la regione 13q14 sul cromosoma 13, che hanno conosciuto harbored il tumore-soppressore RB1, affinchè l'analisi genetica ad alta definizione identificassero i geni del candidato che pregiudicano RB1 usando i polimorfismi del unico nucleotide (SNPs) come indicatori. SNPs è punti nel genoma che variano da una singola particella elementare chimica o dal nucleotide del DNA.

Hanno esaminato 92 SNPs che mappano ad una regione intorno al gene RB1 in 84 campioni appaiati dei tumori della vescica e del DNA di sangue. Questa analisi genetica ad alta definizione ha indicato la stessa sezione del cromosoma che la mappatura istologica e genetica dell'intero organo aveva identificato con espansione delle celle anormali.

Due geni nella regione sono stati trovati per dare a celle un vantaggio genetico minimo iniziale stato necessario per svilupparsi in cancro.

Un gene vicino chiamato ITM2B è stato trovato per essere fatto tacere metilazione, che è la connessione di un gruppo chimico metilico alle parti del gene che lo chiude giù. Nei tumori del cancro di vescica e nelle linee cellulari del cancro, questo gene è stato metilato 40 per cento del tempo.

Un gene conosciuto come P2RY5 situato dentro una parte del gene RB1 è stato influenzato da una serie di cambiamenti del unico nucleotide. Gli studi di caso-control di uno dei moduli variabili del gene sono stati intrapresi facendo uso del DNA di sangue da 790 malati di cancro della vescica e da 712 comandi abbinati per l'età ed il genere. La variazione specifica era presente in 2,78 per cento dei pazienti ed ogni paziente con la variazione che egualmente ha fumato ha sviluppato il cancro di vescica.

I geni del precursore identificati nel cancro di vescica sono stati analizzati per la loro espressione, metilazione e sequenza in 62 linee cellulari derivate dai gruppi importanti di cancri comuni. Delle linee cellulari provate, l'espressione genica del precursore è stata diminuita in 63 per cento dei casi e ITM2B è stato metilato in 42 per cento.

Mentre i geni del precursore downregulated in polmone, in petto, nel sangue e nelle malignità pediatriche, sono stati espressi forte nei cancri di fegato e del colon. Ciò ha significato, la nota dei ricercatori, perché quei due cancri non contano su inattivazione di RB1 per prosperare.

La Ricerca continua. “Ci ha richiesto 10 anni per ottenere dove siamo ora. Con la nuova tecnologia di alto-capacità di lavorazione ora disponibile, completeremo una mappa genetica ad alta definizione di intero genoma per il cancro di vescica nei due seguenti o tre anni,„ Czerniak ha detto.

http://www.mdanderson.org/