癌性ぼうこうの地勢上の遺伝情報を重ねる全器官のマップは正常なセルからの侵略的な癌に分子旅行、ジャーナル実験室の調査で M.D. アンダーソン蟹座の中心のレポートテキサス州立大学で科学者がオンラインで導く国際的な調査チームを図表にします。
地理的に器官の変えられたティッシュを - 正常な、前癌性悪性関連付けることによって、チームは - 根本的な遺伝の変化か規則に…また癌の開発のプロセスを進水させる遺伝子の重大で新しいカテゴリを識別しました。
「これらの 「先行者遺伝子によって」が発癌のエンジンを開始するイグニションキー」、である年長の著者 Bogdan Czerniak、 M.D.、 Ph.D を。、病理学の M.D. アンダーソン部の教授言いました。
「前触れの遺伝子の発見早期検出のための biomarkers を識別するために調査の全く新しいフィールドを開き、癌の防止」はと Czerniak は言いました。 「従来の平均によって検出不可能な」。はとき、これらの遺伝子の不活性化癌の見えない段階の間に発生します
チームは RB1 と呼出される開く主要な腫瘍抑制の遺伝子が沈黙する前に前触れの遺伝子が、侵略的な癌のための道をシャットダウンされなければならないことを報告します。 すべてのティッシュの遺伝の面を特徴付けることによって器官を、研究者照らしました侵略的な癌にさまざまな段階を通して正常なセルを運ぶ出来事の順序を打ち込みます。 膀胱癌の場合には、それらはプロセスを運転する遺伝衝突の 3 つの 「波」を識別しました。
Czerniak の一義的なアプローチは器官のティッシュの顕微鏡の調査と遺伝情報を結合する、または組織学呼出されます全器官の組織学的および遺伝のマップ。
検出、防止、処置のための Biomarkers
Czerniak のマップの技術およびチームの調査結果は精液作業、言いました T. Sudhir Srivastava、 Ph.D を。、蟹座の Biomarkers の研究グループの責任者、国立癌研究所の蟹座防止の分割です。
「前癌性の開発にかかわる遺伝子を識別することはずっと困難なタスクです、本質的に品質の腫瘍の標本のそれらそして入手不能の検出への組織的アプローチの欠乏のために」と Srivastava は言いました。 「Czerniak 先生は M.D. アンダーソンで使用できるリソースを利用し、一義的に genomic 不均衡、前癌性の条件の進行にかかわる臨床的に積極的な膀胱癌に特にそれらにかかわる染色体領域を特徴付けるために彼のグループの遺伝子マップの専門知識を用いることによってこれらの難しさを克服しました。
「これらの調査結果早期検出、監視のための臨床的に有用な biomarkers の開発を加速し、膀胱癌の臨床管理」、は部分的に Czerniak の作業に資金を供給する、 NCI の早期検出の研究ネットワークを導く Srivastava を言いました。
膀胱癌は五番目米国のほとんどの共通癌で、癌の死の 3% を毎年占めます。 それはショーをであるケースの半分の要因調査する煙ることと強く関連付けられます、
研究モデルが上皮の他の癌を調査するのに使用することができます -- ボディの器官の表面そしてキャビティを並べるティッシュ。 上皮性癌、か癌腫はすべての癌より、 80% 構成します。
研究者は膀胱癌の早い開発にかかわる沈黙させた前触れの遺伝子がまた肺、胸、血および共通の小児科の敵意のさまざまなレベルに沈黙することを報告します。
マップは 6 つの染色体領域に方法を導きます
最初の調査結果のマルチステップ遺伝のスクリーニング、確認の調査、遺伝子発現の調査、遺伝子の配列およびメチル化として、候補者の遺伝子の機能調査および疫学的な分析知られているカバーする規定するプロセス 29 ページのペーパーは 7 月問題の元の研究のための実験室の調査のスペースの半分をとます。
「私達は基本的にこのペーパーのための問題を取り除きました」、病理学、免疫学および実験室の薬の薬部のフロリダの大学の大学の雑誌編集者、ジェームス M. クローフォード、 M.D.、 Ph.D。、教授および椅子を言いました。 価値があることを単一のペーパーへの多くのスペースが非常に珍しいこと捧げましたり、クローフォードはそれ確信しますが。 「人このペーパーを読めるべきで、この全体、重要な物語を知るため」はとクローフォードは言いました。
主に正常から前癌性の州にセルを運転する遺伝の削除を含む遺伝衝突の紙の文書 3 の波。 最初の波は遺伝の変更を隠すが、原因となりましたり他では顕微分析の下で正常なようです urothelial セルの広まった拡張の。
第 2 波は今異形成の認識可能な外へ向かう機能 - 前癌性の細胞異常があるセルに成長の利点を提供します。 第 3 波は十分にセルの出現を変形させ、厳しい異形成または上皮内癌のまだ起源のティッシュ、この場合 urothelium に限定される非侵襲的な癌の手始めを特色にします。 上皮内癌および異形成は侵略的な癌に進みます。
チームは 5 つの癌性ぼうこうのティッシュをマップしました。 次に、彼らは遺伝の削除を表示する染色体領域を識別するために 787 の DNA のマーカーを用いました。 器官のティッシュの地理的なマップ上の遺伝の変化の低分解能のマップを重ねることによって、彼らは最初の波および二番目の波のセル両方と関連付けられた領域を識別しました。
追加分析は 6 本の染色体の部分に染色体領域を狭くしました。 この 6 つのサイトは膀胱癌の歴史の 32 人の膀胱癌の患者そして 31 人の無病の患者の尿そして血のそれらの染色体領域の遺伝の損失の多重マーカーのテストによって確認されました。 6 つの領域の少なくとも 1 つからの遺伝の損失は患者の 98% で見つけられました。 ケースの 82% では、 2 つから 5 つの染色体領域は複雑でした。
沈黙させた先行者は腫瘍サプレッサーを窒息させます
チームはマーカーとして単一ヌクレオチドの多形の使用によって RB1 に影響を与える候補者の遺伝子を識別するために隠した高解像の遺伝の分析のための腫瘍サプレッサー RB1 を、知っていた染色体 13 の 13q14 領域を (SNPs)選択しました。 SNPs は単一 DNA の化学ブロックかヌクレオチドによって変わるゲノムのポイントです。
ぼうこうの腫瘍および血 DNA の 84 の組み合わせられたサンプルの RB1 遺伝子のまわりで領域にマップしている彼らは 92 SNPs を検査しました。 この高解像の遺伝の分析は全器官の組織学的および遺伝のマップが異常なセルの拡張と識別した染色体の同じセクションを指しました。
領域の 2 つの遺伝子はセルに癌に育つのに必要とされた最初の最小の遺伝の利点を与えると見つけられました。
ITM2B と呼出された近隣の遺伝子はそれを締める遺伝子の部分へのメチルの化学グループの接続であるメチル化によって沈黙すると見つけられました。 膀胱癌の腫瘍および癌細胞ラインでは、この遺伝子は 40% 時間のメチル化されました。
RB1 遺伝子の部分の中にあった P2RY5 として知られていた遺伝子はいくつかの単一ヌクレオチドの変更によって影響されました。 遺伝子の異なった形式の 1 つのケース制御の調査は年齢および性のために一致した 790 人の膀胱癌の患者および 712 の制御からの血 DNA を使用して行なわれました。 特定の変化は患者の 2.78% にあり、また煙らした変化を用いるあらゆる患者は膀胱癌を開発しました。
膀胱癌で識別された前触れの遺伝子は共通癌の主要なグループから得られた 62 のセルラインの表現、メチル化およびシーケンスのために分析されました。 テストされたセルラインの前触れの遺伝子発現はケースの 63% で減り、 ITM2B は 42% でメチル化されました。
前触れの遺伝子が肺、胸、血および小児科の敵意で downregulated 間、コロンおよび肝臓癌に強く表現されました。 これはそれら二つの癌が RB1 の不活性化に繁栄するために頼らないので、意味、研究者のノートを成しています。
研究は続きます。 「私達が今あるところで得るために私達に 10 年かかりました。 使用できる今新しい高スループット技術によって私達は次の 2 の膀胱癌のための全体のゲノムの高解像の遺伝のマップを完了しますまたは 3 年」と Czerniak は言いました。
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