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a avaliação genomic do Inteiro-Órgão descreve a viagem de normal à pilha maligno

Published on May 5, 2008 at 6:33 PM · No Comments

os mapas do Inteiro-Órgão que sobrepor a informação genética sobre o terreno de bexigas cancerígenos fazem um mapa da viagem molecular da pilha normal ao cancro invasor, uma equipa de investigação internacional conduzida por cientistas Nos relatórios do Centro do Cancro da Universidade do Texas M.D. Anderson em linha na Investigação do Laboratório do jornal.

Geogràfica relacionando os tecidos variados de um órgão - normais, precancerous e malignos - a seu variação ou regulamento genético subjacente, a equipe igualmente identificou uma categoria nova crucial de genes que lançasse o processo de revelação do cancro.

“Este “o precursor que os genes” são a chave de ignição que liga o motor da carcinogénese,” disse autor Bogdan superior Czerniak, M.D., Ph.D., professor no Departamento do M.D. Anderson da Patologia.

A “Descoberta de genes do precursor abre um campo de investigação inteiramente novo para identificar biomarkers para a detecção atempada e prevenção do cancro,” Czerniak disse. A “Inactivação destes genes ocorre durante a fase invisível do cancro, quando é indetectável por meios tradicionais.”

A equipe relata que os genes do precursor devem ser fechados antes que um gene desupressão principal chamado RB1 esteja silenciado, pavimentando a maneira para o cancro invasor. Caracterizando os aspectos genéticos de todo o tecido dactilografa dentro o órgão, os pesquisadores iluminou a seqüência de eventos que leva uma pilha normal através das várias fases ao cancro invasor. No caso do cancro de bexiga, identificaram três “ondas” das batidas genéticas que conduzem o processo.

A aproximação original de Czerniak é chamada o traço histologic e genético do órgão inteiro, que combina a informação genética com o estudo microscópico do tecido do órgão, ou a histologia.

Biomarkers para a detecção, prevenção, tratamento

As técnicas de traço de Czerniak e os resultados da equipe são trabalho seminal, disseram T. Sudhir Srivastava, Ph.D., chefe dos Biomarkers Grupo de Investigação do Cancro, Divisão da Prevenção do Cancro do Instituto Nacional para o Cancro.

“Identificar os genes envolvidos na revelação precancerous foi uma tarefa laboriosa, primeiramente na falta de uma aproximação sistemática a descobrir os e a indisponibilidade de espécimes do tumor da qualidade,” Srivastava disse. O “Dr. Czerniak superou estas dificuldades utilizando os recursos disponíveis em M.D. Anderson e empregando a experiência detraço de seu grupo para caracterizar excepcionalmente as regiões cromossomáticas envolvidas em desequilíbrios genomic, particularmente aqueles envolvidos na progressão de circunstâncias precancerous ao cancro de bexiga clìnica agressivo.

“Estes resultados acelerarão a revelação de biomarkers clìnica úteis para a detecção atempada, fiscalização, e gestão clínica do cancro de bexiga,” disse Srivastava, que conduz a Rede da Pesquisa da Detecção Atempada do NCO, que financia parcialmente o trabalho de Czerniak.

O cancro de Bexiga é o quinto a maioria de cancro comum nos Estados Unidos e esclarece 3 por cento de mortes do cancro anualmente. É associado fortemente com o fumo, que estuda a mostra é um factor ao meio dos casos

O modelo da pesquisa pode ser usado para estudar outros cancros do epitélio -- o tecido que alinha as superfícies e as cavidades dos órgãos do corpo. Os cancros Epiteliais, ou as carcinomas, compo 80 por cento de todos os cancros.

Os pesquisadores relatam que os genes silenciados do precursor envolvidos na revelação adiantada do cancro de bexiga estão silenciados igualmente em diferentes graus no pulmão, no peito, no sangue e em malignidades pediatras comuns.

O Mapa conduz a maneira a seis regiões cromossomáticas

A página 29 de papel, que cobre a selecção genética da multi-etapa, os estudos da validação de resultados iniciais, os estudos da expressão genética, arranjar em seqüência do gene e um processo regulador conhecido como o methylation, estudos funcionais de genes do candidato e análise epidemiológica, pega a metade do espaço da Investigação do Laboratório para a pesquisa original em sua edição de Julho.

“Nós cancelamos basicamente para fora a edição para este papel,” disse o editor de jornal, o James M. Crawford, o M.D., o Ph.D., o professor e a cadeira da Universidade da Faculdade de Florida do Departamento da Medicina da Patologia, da Imunologia e da Medicina do Laboratório. Está Devotando que muito espaço a um único papel é altamente incomum, mas Crawford é-lhe convencido que de valor. “Uma pessoa deve poder ler este papel e para conhecer esta história inteira, importante,” Crawford disse.

As ondas dos originais de papel três de batidas genéticas, envolvendo principalmente os supressões genéticos, que conduzem pilhas de normal aos estados precancerous. A primeira onda conduz a expansão difundida das pilhas urothelial que abrigam mudanças genéticas mas parece de outra maneira normal sob a análise microscópica.

A segunda onda fornece uma vantagem do crescimento às pilhas que têm agora características externas reconhecíveis da displasia - anomalias celulares precancerous. A terceira onda transforma inteiramente a aparência da pilha e caracteriza o início de in situ cancro severo da displasia ou de carcinoma, de não invasor ainda limitado a seu tecido da origem, neste caso o urothelium. Avanço in situ de Carcinoma e da displasia ao cancro invasor.

A equipe traçou o tecido de cinco bexigas cancerígenos. Em Seguida, empregaram 787 marcadores do ADN para identificar as regiões cromossomáticas que indicam supressões genéticos. Sobrepor o mapa da baixo-definição da variação genética sobre o mapa geográfico do tecido do órgão, identificaram as regiões associadas com a primeiro-onda e as pilhas da segundo-onda.

A análise Adicional reduziu as regiões cromossomáticas às parcelas de seis cromossomas. Estes seis locais foram confirmados testando marcadores múltiplos da perda genética naquelas regiões cromossomáticas na urina e no sangue de 32 pacientes que sofre de cancro da bexiga e de 31 pacientes sãos com uma história do cancro de bexiga. As perdas Genéticas pelo menos de uma das seis regiões foram encontradas em 98 por cento dos pacientes. Em 82 por cento dos casos, duas a cinco regiões cromossomáticas eram involvidas.

Os precursores Silenciados reprimem um tumor-supressor

A equipe escolheu a região 13q14 no cromossoma 13, que conheceu abrigou o tumor-supressor RB1, para que a análise genética de alta resolução identifique os genes do candidato que afetam RB1 usando polimorfismo do único-nucleotide (SNPs) como marcadores. SNPs é os pontos no genoma que variam por um único bloco de apartamentos químico ou pelo nucleotide do ADN.

Examinaram 92 SNPs que traçam a uma região em torno do gene RB1 em 84 amostras emparelhadas de tumores da bexiga e de ADN do sangue. Esta análise genética de alta resolução aguçado à mesma secção do cromossoma que o traço histologic e genético do órgão inteiro tinha identificado com expansão de pilhas anormais.

Dois genes na região foram encontrados para dar a pilhas uma vantagem genética mínima inicial necessário para crescer no cancro.

Um gene vizinho chamado ITM2B foi encontrado para ser silenciado pelo methylation, que é a conexão de um grupo químico metílico às parcelas do gene que o fecha para baixo. Em tumores do cancro de bexiga e em linha celular do cancro, este gene foi misturado 40 por cento do tempo.

Um gene conhecido como P2RY5 situado dentro de uma parcela do gene RB1 foi afectado por um número de mudanças do único-nucleotide. Um estudo do caso-controle de um dos formulários variantes do gene foi conduzido usando o ADN do sangue de 790 pacientes que sofre de cancro da bexiga e de 712 controles combinados para a idade e o género. A variação específica estou presente em 2,78 por cento dos pacientes e do cada paciente com a variação que também cancro de bexiga desenvolvido fumado.

Os genes do precursor identificados no cancro de bexiga foram analisados para seus expressão, methylation e seqüência em 62 linha celular derivadas dos grupos principais de cancros comuns. Das linha celular testadas, a expressão genética do precursor foi reduzida em 63 por cento dos casos e ITM2B foi misturado em 42 por cento.

Quando os genes do precursor downregulated no pulmão, no peito, no sangue e em malignidades pediatras, foram expressados fortemente nos dois pontos e nos cancros do fígado. Isto faz o sentido, a nota dos pesquisadores, porque aqueles dois cancros não confiam na inactivação de RB1 a fim prosperar.

A Pesquisa continua. “Tomou-nos 10 anos para obter onde nós estamos agora. Com a tecnologia nova da alto-produção agora disponível, nós terminaremos um mapa genético de alta resolução do genoma inteiro para o cancro de bexiga nos dois seguintes ou três anos,” Czerniak disse.

http://www.mdanderson.org/