карты Вс-Органа которые перекрывают генетическую информацию над местностью раковидных пузырей составляют схему молекулярному путешествию от нормальной клетки к инвазионному раку, международной научно-исследовательской группе водить научными работниками на Отчетах о Центра Карциномы D. Андерсона Техасского Университета M. он-лайн на Исследовании Лаборатории журнала.
географически относить ткани органа поменянные - нормальные, предраковые и злокачественные - к их основным генетическим изменению или регулировке, команда также определила критическую новую категорию генов которая запускает процесс развития рака.
«Эт «предшественник гены» ключ зажигания который начинает двигатель канцерогенеза,» сказал старшее автор Bogdan Czerniak, M.D., Ph.D., профессор в Отделе D. Андерсона M. Патологии.
«Дисковери генов предшественника раскрывает полностью новое поле исследования для того чтобы определить biomarkers для раннего выявления и предохранение рака,» Czerniak сказало. «Инактивирование этих генов происходит во время этапа рака незримого, когда оно undetectable традиционными серединами.»
Команда сообщает что гены предшественника необходимо выключить прежде чем заставлен замолчать главный тумор-подавляя вызванный ген RB1, вымощая путь для инвазионного рака. Путем характеризовать генетические аспекты всей ткани печатает внутри орган на машинке, исследователя осветил последовательность случаев которая носит нормальную клетку через различные этапы к инвазионному раку. В случае рака пузыря, они определили 3 «волны» генетических ударов которые управляют процессом.
Подход к Czerniak уникально вызван отображать всем органом histologic и генетический, который совмещает генетическую информацию с микроскопическим изучением ткани органа, или гистология.
Biomarkers для обнаружения, предохранения, обработки
Методы Czerniak отображая и заключения команды полуфинальная работа, сказали T. Sudhir Srivastava, Ph.D., вождь Biomarkers Исследовательской Группы Карциномы, Разделения Предохранения Карциномы Национального Института Раковых Заболеваний.
«Определять гены, котор включили в предраковое развитие трудная задача, главным образом из-за отсутствия систематического подхода к открывать их и non-наличие образцов тумора качества,» Srivastava сказало. «Др. Czerniak отжимал эти затруднения путем использовать ресурсы доступные на D. Андерсоне M. и использовать Джин-отображая экспертизу его группы уникально для того чтобы характеризовать хромосомные зоны, котор включили в genomic разницы, в частности те, котор включили в прогрессирование предраковых условий к клинически агрессивныйому раку пузыря.
«Эти заключения ускорят ход развития клинически полезных biomarkers для раннего выявления, наблюдения, и клиническое управление рака пузыря,» сказал Srivastava, которое водит Сеть Исследования Раннего Выявления NCI, которая частично фондирует работа Czerniak.
Рак Пузыря пятая часть большинств общий рак в Соединенные Штаты и определяет 3 процента смертей рака однолетн. Он сильно связан с курить, который изучает выставку фактор в половине случаев
Модель исследования можно использовать для того чтобы изучить другие раки эпителия -- ткань которая выравнивает поверхности и полости органов тела. Эпителиальные раки, или карциномы, составляют 80 процентов всех раков.
Исследователя сообщают что заставленные замолчать гены предшественника, котор включили в предыдущее развитие рака пузыря также заставлены замолчать к разным степеням в легкем, груди, крови и общих педиатрических злобностях.
Карта водит путь до 6 хромосомных зон
Страница 29 бумажная, которая покрывает скрининг multi-шага генетический, анализы беспристрастности начальных заключений, изучения выражения гена, sequencing гена и регламентационный процесс известный как метилирование, функциональные изучения генов выбранного и эпидемиологический анализ, принимает вверх половину космоса Исследования Лаборатории для первоначально исследования в своем вопросе в Июль.
«Мы по-существу освободили вне вопрос для этой бумаги,» сказал редактору журнала, Джеймс M. Кроуфорду, M.D., Ph.D., профессору и стулу Университета Коллежа Флориды Отдела Медицины Патологии, Иммунологии и Медицины Лаборатории. Посвящают что много космоса к одиночной бумаге сильно необыкновенны, только Кроуфорд убежены ему стояща. «Персона должна мочь прочитать эта газета и знать этот весь, важный рассказ,» Кроуфорд сказал.
Печатные документы 3 волны генетических ударов, главным образом включая генетические пропускания, которые управляют клетками от нормальной к предраковым положениям. Первая волна водит к широко распространённый расширению urothelial клеток которые затаивают генетические изменения но в противном случае кажется нормальной под микроскопическим анализом.
Вторая волна снабубежит преимущество роста клетки которые теперь имеют узнаваемые наружные характеристики дисплазии - предраковые клетчатые ненормальности. Третья волна полно преобразовывает возникновение клетки и отличает натиском строгих дисплазии или рака in situ, неинвазивного рака все еще ограничиваемого к своей ткани начала, в этот случай urothelium. Рак in situ и дисплазия выдвигаются к инвазионному раку.
Команда отобразила ткань 5 раковидных пузырей. Затем, они использовали 787 отметок ДНА для того чтобы определить хромосомные зоны которые показывают генетические пропускания. Путем перекрывать карту низк-разрешения генетического изменения над географической картой ткани органа, они определили зоны связанные как с перв-волной, так и с клетками втор-волны.
Дополнительный анализ сужал хромосомные зоны к частям 6 хромосом. Эти 6 мест были подтвержены путем испытывать множественные отметки генетической потери в тех хромосомных зонах в моче и крови 32 онкологических больных пузыря и 31 заболевани-свободного пациента с историей рака пузыря. Генетические потери от хотя бы одной из 6 зон были найдены в 98 процентах пациентов. В 82 процентах случаев, 2 до 5 хромосомных зоны были включены.
Заставленные Замолчать предшественники stifle тумор-усмиритель
Команда выбрала зону 13q14 на хромосоме 13, которую они знали затаили тумор-усмирителя RB1, для анализа высок-разрешения генетического для того чтобы определить гены выбранного влияя на RB1 путем использование полиморфизмов одиночн-нуклеотида (SNPs) как отметки. SNPs пункты в геноме которые меняют одиночным строительным блоком или нуклеотидом ДНА химическим.
Они рассмотрели 92 SNPs отображая к зоне вокруг гена RB1 в 84 спаренных образцах туморов пузыря и ДНА крови. Этот анализ высок-разрешения генетический указал к такому же разделу хромосомы которую отображать всего органа histologic и генетический определил с расширением анормалных клеток.
Были найдены, что дали 2 гена в зоне клеткам начальное минимальное генетическое преимущество необходимы для того чтобы вырасти в рак.
Был найдены, что был заставлен замолчать соседский вызванный ген ITM2B метилированием, которое соединение метиловой химической группы к частям гена который закрывает его вниз. В туморах рака пузыря и линиях раковой клетки, этот ген был метилирован 40 процентов времени.
Ген известный как P2RY5 расположенное внутри части гена RB1 был повлиян на несколькими изменений одиночн-нуклеотида. Изучение случа-управления одной из форм гена различных было дирижировано используя ДНА крови от 790 онкологических больных пузыря и 712 управлений, котор соответствуют для времени и рода. Специфическое изменение присутствовало в 2,78 процентах пациентов и каждый пациент с изменением которое также курило начал рак пузыря.
Гены предшественника определенные в раке пузыря были проанализированы для их выражения, метилирования и последовательности в 62 линиях клетки выведенных от главных групп в составе общие раки. испытанных линий клетки, выражение гена предшественника было уменьшено в 63 проценты случаев и ITM2B было метилировано в 42 процентах.
Пока гены предшественника были downregulated в легкем, груди, крови и педиатрических злобностях, они сильно были выражены в двоеточии и раках печени. Это делает чувство, примечание исследователей, потому что те 2 рака не полагаются на инактивировании RB1 для того чтобы преуспевть.
Исследование продолжается. «Оно принял нам 10 лет для того чтобы получить где мы теперь. С новой технологией высок-объём теперь доступной, мы завершим карту высок-разрешения генетическую всего генома для рака пузыря в следующие 2 или 3 лет,» Czerniak сказало.
http://www.mdanderson.org/