叠加在癌膀胱地形的基因信息的全部机构映射绘制从正常细胞的分子旅途到入侵的癌症,科学家在线导致的国际研究小组图表在得克萨斯大学 M.D. 安徒生巨蟹星座中心报表在日记帐实验室调查。
通过地理涉及机构的变化的组织 - 正常,癌症前期和恶性 - 与他们的基础基因差异或管理规定,这个小组也识别展开癌症发展的进程基因的一个关键的新的类别。
“这些 ‘基因’是点火开关启动致癌作用引擎”的先行者说高级作者 Bogdan Czerniak, M.D., Ph.D。,病理学的 M.D. 安徒生的部门的教授。
“在先行者基因的发现上开张一个全新的调查范围识别早检测的生物标志,并且癌症的预防”, Czerniak 说。 在癌症的无形的阶段期间, “这些基因的钝化作用发生,当它通过传统平均值时是探测不到的”。
这个小组报告必须关闭先行者基因,在称 RB1 的一个主要肿瘤抑制的基因沉默前,铺平道路入侵的癌症的。 通过分析所有组织的基因方面输入这个机构,研究员阐明了通过多种阶段运载一个正常细胞对入侵的癌症的事件顺序。 一旦膀胱癌,他们识别三个 “通知驱动这个进程的”基因命中。
Czerniak 的唯一途径称全部的机构组织和基因映射,与机构组织的微观研究结合基因信息,或者组织学。
检测的,预防,处理生物标志
Czerniak 的映射的技术和小组的发现是精液工作,说 T. Sudhir Srivastava, Ph.D。,巨蟹星座生物标志研究小组的院长,国家癌症学会的癌症预防分部。
“识别在癌症前期的发展介入的基因是一项艰巨任务,主要因缺乏对发现他们和质量肿瘤标本的未利用率的一个系统的途径”, Srivastava 说。 “Czerniak 博士通过使用资源可用在 M.D. 安徒生和雇用他的组基因映射的专门技术唯一地分析在基因组不平衡状态介入的染色体地区克服了这些困难,在癌症前期的情况级数介入的特殊那些对临床积极的膀胱癌。
“这些发现将加速临床早检测的,监视有用的生物标志的发展,并且膀胱癌的临床管理”, Srivastava 说,导致 NCI 的早检测研究网络,部分地资助 Czerniak 的工作。
膀胱癌是五多数公用癌症在美国并且每年占 3% 的癌症死亡。 它严格与抽烟相关,学习显示是在一半的一个系数案件
研究设计可以用于学习皮膜的其他癌症 -- 排行机体的机构的表面和洞的组织。 上皮癌症或者癌,组成 80% 所有癌症。
研究员报告在膀胱癌的早期的发展介入的沉默的先行者基因也沉默对肺、乳房、血液和公用小儿科敌意不同程度。
映射导致方式六个染色体地区
29 页文件,报道多步的基因审查、最初的发现的验证基因表达的研究,研究,基因排序和叫作甲基化的一个管理进程,候选人基因的功能研究和流行病学分析,占去一半实验室原始研究的调查的空间对其 7月问题。
“我们基本上清除了本文的问题”,杂志编辑、詹姆斯 M. 克劳福德, M.D.、 Ph.D。,教授和主席说病理学、免疫学和实验室医学的医学部门佛罗里达学院大学的。 专用对一份唯一文件的空间是高度异常的,但是克劳福德被说服它值得的。 “人员应该能读本文,并且认识此整个,重要故事”,克劳福德说。
主要介入基因删除的基因命中纸张文件三通知,从正常驱动细胞到癌症前期的状态。 第一个通知导致怀有基因更改 urothelial 细胞的普遍扩展,但是否则看上去正常在微观分析下。
第二个通知提供增长好处给现在有发育异常可认识的向外功能 - 癌症前期的蜂窝电话反常性的细胞。 第三个通知充分地变换细胞的外观并且以严重发育异常或原位癌为特色,非侵入性的癌症起始仍然被限制到其组织起源,在这种情况下 urothelium。 原位癌和发育异常提前到入侵的癌症。
这个小组映射了五癌膀胱组织。 其次,他们使用 787 个脱氧核糖核酸标记识别显示基因删除的染色体地区。 通过叠加基因差异低分辨率的映射在机构的组织的地理映射的,他们识别地区与最初通知和第二通知细胞相关。
另外的分析缩小染色体地区对六染色体的部分。 这六个站点通过测试基因损失多个标记在那些染色体地区确认在 32 名膀胱癌病人和 31 名无病患者尿和血液有膀胱癌的历史记录。 从六个地区之至少一的基因损失在 98% 的患者被找到。 在 82% 的案件,二个到五个染色体地区是包含的。
沉默的先行者抑止肿瘤抑制器
这个小组选择了在染色体 13 的 13q14 区域,他们认识怀有高分辨率基因分析的肿瘤抑制器 RB1,能识别影响 RB1 的候选人基因通过使用单一核苷酸多形性 (SNPs)作为标记。 SNPs 是由唯一脱氧核糖核酸化工构件或核苷酸变化在这条染色体的点。
检查 92 SNPs 映射对区域的他们在膀胱肿瘤和血液脱氧核糖核酸 84 个配对的范例的 RB1 基因附近。 此高分辨率基因分析指向全部的机构组织和基因映射识别与异常细胞扩展染色体的同一个部分。
在这个区域发现二个基因产生细胞必要的一个最初的最小的基因好处增长到癌症。
发现称 ITM2B 的一个相邻的基因由甲基化沉默,是甲醇化工组连接数与基因的部分关闭它。 在膀胱癌肿瘤和癌症细胞系,此基因甲基化了 40% 的时间。
叫作 P2RY5 的基因位于在这个 RB1 基因里面的部分是受一定数量的单一核苷酸更改的影响的。 情形控制研究的其中一份基因的不同的表单进行了使用从为年龄和性别和 712 个控制的血液脱氧核糖核酸符合的 790 名膀胱癌患者。 特定差异在 2.78% 是存在的患者,并且有也抽烟的差异的每名病人患了膀胱癌。
在膀胱癌识别的先行者基因对于他们的表达式、甲基化和顺序分析在从主要组派生的 62 细胞系公用癌症。 细胞系,先行者基因表达在 63% 的案件减少了,并且被测试的 ITM2B 在 42% 甲基化了。
当先行者基因在肺、乳房、血液和小儿科敌意时 downregulated,他们用冒号和肝癌严格表示。 因为那两癌症不依靠 RB1 的钝化作用为了兴旺,这有意义,研究员附注。
研究继续。 “需要我们 10 年获得我们现在的地方。 可用现在新的高处理量的技术,我们将完成整个染色体的高分辨率基因映射膀胱癌的在下二或三年”, Czerniak 说。
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