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Drei sequenziell ordnende Firmen schließen sich dem 1000 Genom-Projekt an

Published on June 11, 2008 at 11:40 AM · No Comments

Führer der 1000 Genome Stehen heute angekündigt vor, dass drei Unternehmen, die mit Entwicklung von neuen Sequenziertechniken vorangegangen haben, sich der internationalen Bemühung angeschlossen haben, die ausführlichste Karte der menschlichen genetischen Variante als Hilfsmittel für medizinische Forschung bis jetzt aufzubauen. Die neuen Teilnehmer sind: 454 Biowissenschaften, eine Roche-Firma, Branford, Anschl.; Angewandte Biosysteme, ein Applera Corp.-Geschäft, PflegeStadt, Calif.; und Illumina Inc., San Diego.

Das 1000 Genom-Projekt, das im Januar 2008 angekündigt wurde, ist ein internationales Forschungskonsortium, das eine neue Karte des menschlichen Genoms herstellt, das eine Ansicht von biomedizinisch relevanten DNS-Varianten an einer Auflösung zur Verfügung stellt, die durch aktuelle Betriebsmittel nicht angepasst ist. Einteilungen, die bereits bedeutende Halterung am Projekt festgelegt haben, sind: das Peking-Genomics-Institut, Shenzhen, China; das Wellcome-Trust Sanger-Institut, Hinxton, Cambridge, Großbritannien; und das Nationale Menschliches Genom-Forschungsinstitut (NHGRI), Teil der Nationalen Institute der Gesundheit. Die NHGRI-unterstützte Arbeit wird vom Institut erledigt? umfangreiches Sequenziell Ordnendes Netz s, das das Menschliche Genom umfaßt, das Mitte an Baylor-College von Medizin Sequenziell Ordnet, Houston; das Breite Institut von MIT und von Harvard, Cambridge, Mass.; und das Washington-HochschulGenom, das Mitte an der Washington-HochschulMedizinischen Fakultät, St. Louis Sequenziell Ordnet.

„Die zusätzliche sequenziell ordnende Kapazität und die Sachkenntnis, die von den drei Firmen in der Versuchsphase zur Verfügung gestellt werden, aktivieren uns, das menschliche Genom mit sogar größerer Tiefe und Drehzahl, als zu erforschen wir uns ursprünglich, die Auslegung der vollen Studie zu optimieren, um zu folgen uns vorgestellt und werden helfen hatten, „sagte Richard Durbin, Ph.D., des Wellcome-Trust Sanger-Instituts, das Mitvorsitzender des Konsortiums ist. ? Es ist eine Anordnung mit Gewinn für beide Parteien für ganz beteiligtes. Die Firmen gewinnen eine aufregende Gelegenheit, ihre Technologien auf Hunderten von den Proben menschlicher DNS zu prüfen, und das Projekt erhält Daten und Einblick, um seine Ziele in einer effizienteren und kosteneffektiveren Art, als zu erzielen wir könnten ohne ihre Hilfe.“

Die Erbsubstanzen oder die Genome, aller möglicher zwei Menschen sind mehr als 99 Prozent die selben. Noch hält der kleine Bruch des Genmaterials, das unter Leuten schwankt, wertvolle Anhaltspunkte zu den einzelnen Unterschieden bezüglich der Anfälligkeit zur Krankheit, zur Antwort zu den Drogen und zur Empfindlichkeit zu den Umweltfaktoren an.

Die 1000 Genome Stehen Gestalten nach dem Internationalen HapMap-Projekt vor, das einen umfassenden Katalog der menschlichen genetischen Variante produzierte? Variante, die in Nachbarschaften organisiert wird, rief Haplotypes. Der HapMap-Katalog legte den Grundstein für die neue Explosion von Genom-weiten Vereinigungsstudien, die mehr als 130 genetische Varianten gekennzeichnet haben, die mit einer großen Auswahl von geläufigen Krankheiten, einschließlich Baumuster - Diabetes 2, Koronararterienleiden, Prostata und Brustkrebse, rheumatoide Arthritis, entzündliche Darmerkrankung und einige Geisteskrankheiten verbunden werden.

Der HapMap-Katalog jedoch kennzeichnet nur genetische Varianten, die anwesend bei einer Frequenz von 5 Prozent oder größer sind. Der Katalog, der durch das 1000 Genom-Projekt produziert wird, bildet viele mehr Details des menschlichen Genoms ab und wie er unter den Einzelpersonen schwankt und genetische Varianten kennzeichnet, die bei einer Frequenz von 1 Prozent über die meisten des Genoms und unten zu 0,5 Prozent oder niedriger innerhalb der Gene anwesend sind. Das 1000 Genom-Projekt? hochauflösender Katalog s dient, viele zukünftigen Studien von Leuten mit spezifischen Krankheiten zu beschleunigen.

„Irgendwie, ist diese Anwendung der neuen Sequenziertechniken wie aufbauende größere Teleskope,“ sagte NHGRI Direktor Francis S. Collins, M.D., Ph.D. „Gerade während Astronomen weit und offenbar in das Universum mit größeren Teleskopen sehen, die Ergebnisse der 1000 Genome, die Projekt uns größere Auflösung gibt, wie wir unsere eigene Erbsubstanz ansehen. Wir? ll ist in der Lage, mehr Sachen offenbar zu sehen, als vor und das seien Sie wichtig für das Verständnis der genetischen Beiträge zur Gesundheit und zur Krankheit.“

Das HapMap basierte hauptsächlich auf genotyping Technologie, in der Erbfaktoren verwendet wurden, um das Genom breit zu scannen. Demgegenüber wird der 1000 Genom-Projektkatalog auf Sequenziertechnik, in der das Genom auf dem Niveau von einzelnen DNS-Schreiben geprüft wird, oder Basis aufgebaut. Die erhöhte Auflösung aktiviert die 1000 Genome? bilden Sie ab, um Forscher mit weit genomischerem Zusammenhang als das HapMap, einschließlich genauere Informationen über die genetischen Varianten zu versehen, die möglicherweise direkt zur Krankheit beitrügen.

„Wir finden, dass es viel Wert bei der Teilnahme an den internationalen Konsortien gibt; sie produzieren große Datensätze, die zu den wissenschaftlichen und medizinischen Gemeinschaften, bei der Förderung der schnellen Freigabe der Daten“ Illumina Vizepräsidenten und Leiter-Wissenschaftler David Bentley sagte, Ph.D. wertvoll sind, der am Internationalen HapMap-Projekt teilnahm.

Um die Produktion der 1000 Genome zu erhöhen bilden Sie, jede der drei Biotech-Firmen hat damit einverstanden sind das Äquivalent von 75 Milliarde DNS-Basis als Teil der Versuchsphase sequenziell zu ordnen ab. Das menschliche Genom enthält ungefähr 3 Milliarde Basis. Infolgedessen trägt jede Firma das Äquivalent von 25 menschlichen Genomen in dem nächsten Jahr und die zusätzlichen Reihenfolgendaten über dem Projekt bei? s erwartete dreijährige Zeitachse. Darüber hinaus tragen Angewandte Biosysteme zusätzliche 200 Milliarde Basis der menschlichen Reihenfolge durch seine Zusammenarbeit mit Baylor bei.

„Dieses Projekt ist offenbar die ehrgeizigste und umfassendste Studie bis jetzt des menschlichen Genoms. Unsere Teilnahme setzt unsere Verpflichtung fort, um sich mit der wissenschaftlichen Gemeinschaft zusammenzutun, um die Erbfaktoren zu erforschen, die in menschliche Krankheit mit einbezogen werden,“ sagte Francisco de la Vega, bemerkenswertes wissenschaftliches Gegenstück und Vizepräsident für Feste Anlagen-Anwendungen und Bioinformatik an Angewandten Biosystemen.