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三家排序的公司連接 1000 條染色體項目

Published on June 11, 2008 at 11:40 AM · No Comments

1000 條染色體的領導先鋒設想今天宣佈作早期工作在新的排序的技術的發展的三個固定連接了國際工作成績迄今編譯最詳細的映射人力基因差異作為為醫學研究的工具。 新的參與者是: 454 生命科學, Roche 公司, Branford, Conn。; 應用的生物系統, Applera 公司商業,養育城市,加利福尼亞; 并且 Illumina Inc.,聖迭戈。

1000 條染色體項目,在 2008年 1月宣佈,是創建人類基因組新的映射將提供生物醫學上相關脫氧核糖核酸差異視圖在解決方法不匹配由當前資源的一個國際研究財團。 已經承諾了專業技術支持給這個項目的組織是: 北京染色體組的學院,深圳,中國; Wellcome 信任 Sanger 學院, Hinxton,劍橋,英國; 并且國家人類基因組研究所 (NHGRI),一部分的國家衛生研究所。 這個 NHGRI 支持的工作由這所學院完成?s 大規模排序的網絡,包括排序中心的人類基因組在醫學 Baylor 學院,休斯敦; MIT 和哈佛,劍橋,質量清楚的學院。; 并且排序中心的華盛頓大學染色體在華盛頓大學醫學院,聖路易斯。

「三家公司和專門技術提供的另外的排序的能力在試驗階段內比我們原來地構想了和幫助我們優選這個充分的研究的設計按照將使我們測試與更加了不起的深度和速度的人類基因組, 「理查 Durbin, Ph.D 說。, Wellcome 信任 Sanger 學院,是這個財團的聯合主席。 ?它是所有包含的雙贏的排列。 公司將獲取一個扣人心弦的機會測試他們的在數百的技術人力脫氧核糖核酸範例,并且這個項目比我們可能,不用他們的幫助將得到數據和答案達到其目標以一個更加高效和更加有效的方式」。

基因圖紙或者染色體,任何二個人是超過 99% 同樣。 但是,在人中變化基因的小的分數暫掛重要的提示向在感受性上的個體差異對疾病、藥物反應和區分對環境因素。

1000 條染色體設想編譯在國際 HapMap 項目,生產人力基因差異一個全面目錄? 被組織到鄰里的差異叫單模標本。 HapMap 目錄打了識別超過與各種各樣的常見病被鏈接的 130 個基因變形,包括第二類型糖尿病、冠狀動脈病、前列腺和乳腺癌、風濕性關節炎、激動的腸炎和一定數量的精神病染色體關聯研究的最近展開的基礎。

HapMap 目錄,然而,只識別是存在以 5% 頻率或更加極大的基因變形。 1000 條染色體項目生產的這個目錄將映射人類基因組的許多詳細資料,并且它如何在單個中變化,識別是存在以 1% 頻率在多數間的這條染色體和下來到 0.5% 或低在基因內的基因變形。 1000 條染色體項目?s 高分辨率目錄將服務加速人的許多將來的研究以特定病症。

「在一些方面,新的排序的技術的此應用是像編譯的更大的望遠鏡」,弗朗西斯 S. 林斯, M.D., Ph.D 主任說 NHGRI。 「正天文學家和更加清楚看見到與更大的望遠鏡的宇宙, 1000 條染色體項目的結果將產生我們更加巨大的解決方法,我們查看我們自己的基因圖紙。 我們?ll 比前面和那對瞭解對健康和病症的能更加清楚看更多事物基因攤繳重要」。

HapMap 主要在 genotyping 的技術基礎上,基因標記用於寬廣地瀏覽這條染色體。 相反, 1000 條染色體項目目錄在排序將被編譯技術,這條染色體被檢查在各自的脫氧核糖核酸信函的級別,否则基礎。 這個增加的解決方法將啟用 1000 條染色體? 比 HapMap 映射提供研究員以基因組環境,包括關於也許直接地造成疾病的基因變形的更加準確的信息。

「我們發現有在參加的很多值國際財團; 他們導致對科學和醫學界有價值的大數據集,當促進數據的迅速版本」大衛 Bentley, Ph.D 副總統和院長科學家說 Illumina。時,參加國際 HapMap 項目。

作為試驗階段一部分,要提高 1000 條染色體的生產请映射,三家生物科技公司中的每一家有同意排序 750億脫氧核糖核酸基礎等同。 人類基因組包含大約 30億基礎。 結果,每家公司在下一年期間將貢獻 25 人類基因組等同和在這個項目的另外的順序數據?s 期望的三年的時間安排。 另外,應用的生物系統將貢獻人力順序另外的 2000億基礎通過其與 Baylor 的協作。

「此項目迄今明顯地是最雄心勃勃和最全面的研究的人類基因組。 我們的參與繼續我們的承諾成為夥伴以科學界測試在人力疾病介入的遺傳因素」,弗朗西斯科 de 固定的系統應用和分析複雜生物資料的學科的 la Vega、著名的科學研究員和副總統說在應用的生物系統。