Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Filipino | Русский | Svenska | Polski

Een globaal DNA- streepjescodegegevensbestand

Published on June 30, 2008 at 5:36 AM · No Comments

Het idee van het barcoding is vertrouwd aan velen: in bijna elke supermarkt die toont de controleexploitant het kaartje met een reeks zwarte bars aan een laserscanner wordt geëtiketteerd die met een pieper antwoordt; de een computeranalyses de code, identificeert het product en de prijs wordt verzonden naar tot.

Nu, in een ambitieus initiatief willen de wetenschappers dit concept op het leven toepassen door DNA te gebruiken - de unieke streepjescode van de aard van elke species van dier, plant en microbe - om een enorme bibliotheek van elk het leven organisme op de planeet te creëren. Zulk een globale DNA- streepjescodegegevensbestand zou onschatbaar op talrijke manieren, van het identificeren van nieuwe species van organisme en de controle van biodiversiteit aan het ontdekken van fraude blijken.

Het initiatief ECBoL poogt een Netwerk van Europese Belangrijke Laboratoria (NELL) onder de belangrijke centra van het biodiversiteitsmiddel van Europa op te zetten. Dit netwerk zal de capaciteit hebben om DNA- streepjescodes van species bij een industriële schaal te produceren, voor het identificeren van het leven ter wereld. Zodra gevestigd, heeft het consortium aanvankelijk een doel aan streepjescode1M specimens, die 100K species vertegenwoordigen binnen 5 jaar. De Verdere initiatieven zullen worden gelanceerd om het streepjescodegegevensbestand uit te breiden in een poging om al bekend en tot hiertoe onbekend leven ter wereld Te vertegenwoordigen.

De „streepjescodes“ in het leven organismen zijn korte opeenvolgingen van genetisch materiaal die aan dat organisme uniek zijn. In dieren, bijvoorbeeld, is een bepaalde genopeenvolging in een structuur in de cel genoemd mitochondrion getoond uniek om aan om het even welke bepaalde species te zijn. De Gelijkaardige opeenvolgingen zijn gevonden voor installaties, en de wetenschappers zoeken actief naar streepjescodegenen in bacteriën, paddestoelen en andere micro-organismen.

Het is essentieel dat zulk een initiatief in werkingsgebied internationaal is, en op de vergadering EuroBioForum van dit jaar in Straatsburg in September, zal Professor Pedro Crous het geval voor de betrokkenheid van Europa in de Internationale Streepjescode van het initiatief van het Leven zetten.

„Het barcoding van DNA zal ons toestaan om een beter inzicht in het leven te krijgen en een betere appreciatie van het leven,“ zegt Crous, die directeur van het Centrum van de Biodiversiteit van CBS Schimmel in Utrecht, Nederland is.

Het belangrijkste voordeel van het barcoding van DNA over traditionele taxonomie om organismen te identificeren is het potentieel voor zijn grote snelheid en nauwkeurigheid. „Conventioneel worden de organismen geïdentificeerd grotendeels gebaseerd op aspecten zoals hun grootte, kleur en de unieke morfologische eigenschappen,“ zegt Crous. „Dit leidt tot een situatie waar vele species slechts door taxonomische deskundigen kunnen worden geïdentificeerd, die weinigen en ver tussen zijn. Dit kan het moeilijk maken om bekende species evenals nieuwe degenen te identificeren. Het barcoding van DNA zou dit alles.“ oplossen

Het concept is eenvoudig. Een steekproef van het specimen wordt verwerkt om de streepjescode uit te vaardigen. Dit wordt dan aangepast tegen een bibliotheek van bekende streepjescodes en op deze wijze wordt het specimen geïdentificeerd.

„Zo als een verzending van exotische dieren bij het douanepunt aankomt, kunt u bepalen zeer snel als het of niet bedreigde species bevat en de geïmpliceerde importeurs waarneemt,“ Crous zegt. „U kunt een gehele waaier van complexe ecologische en biodiversiteitsvragen ook beantwoorden.“

Om dit te doen, moet het streepjescodegegevensbestand eerst worden geconstrueerd. De Internationale Streepjescode van het initiatief van het Leven werd voorgesteld door Canadese wetenschappers en wil 150 miljoen Canadese dollars (net onder 100 miljoen euro) aan streepjescode 500.000 opheffen species in de loop van de volgende vijf jaar. De logistiek zal onvermijdelijk complex zijn, zodat stelt het initiatief een reeks centrale en regionale „knopen voor“ om de activiteit over de wereld te financieren en te coördineren. In De Loop Van de jaren hoopt men dat elke species - verscheidene miljoen - uiteindelijk met streepjescode zullen zijn.