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Uma base de dados global do código de barras do ADN

Published on June 30, 2008 at 5:36 AM · No Comments

A ideia de barcoding é familiar a muitos: em quase cada supermercado o operador de verificação geral mostra o bilhete etiquetado com uma série de barras pretas a um varredor de laser qual responde com um sinal acústico; as análises de computador o código, identificam o produto e o preço é enviado ao até.

Agora, em uma iniciativa ambiciosa os cientistas querem aplicar este conceito à vida usando ADN - o código de barras original da natureza de cada espécie de animal, de planta e de micróbio - para criar uma biblioteca vasta de cada organismo vivo no planeta. Uma base de dados tão global do código de barras do ADN provaria inestimável em maneiras numerosas, de identificar a espécie nova de organismo e de monitorar a biodiversidade a detectar a fraude.

A iniciativa de ECBoL aponta estabelecer uma Rede dos Laboratórios Principais Europeus (NELL) entre centros principais do recurso da biodiversidade de Europa. Esta rede terá a capacidade gerar códigos de barras do ADN das espécies em uma escala industrial, para identificar a vida na terra. Uma Vez Que estabelecido, o consórcio tem um objetivo inicialmente aos espécimes do código de barras 1M, representando a espécie 100K dentro de 5 anos. Umas iniciativas Mais Adicionais serão lançadas para expandir a base de dados do código de barras na tentativa de representar toda a vida conhecida e até agora desconhecida na Terra.

Os “códigos de barras” em organismos vivos são as seqüências curtos do material genético que são originais a esse organismo. Nos animais, por exemplo, uma seqüência particular do gene em uma estrutura na pilha chamada o mitochondrion foi mostrada para ser original a qualquer espécie dada. As seqüências Similares foram encontradas para plantas, e os cientistas estão procurarando activamente por genes do código de barras nas bactérias, nos fungos e nos outros micro-organismos.

É essencial que tal iniciativa é internacional no espaço, e na reunião do EuroBioForum deste ano em Strasbourg em setembro, o Professor Pedro Crous estará pondo o argumento para a participação de Europa no Código de barras Internacional da iniciativa da Vida.

O “ADN que barcoding permitirá que nós obtenham uma compreensão melhor da vida e uma apreciação melhor da vida,” diz Crous, que é director do Centro Fungoso da Biodiversidade de CBS em Utrecht, Os Países Baixos.

A vantagem chave do ADN que barcoding sobre a taxonomia tradicional para identificar organismos é o potencial para suas grandes velocidade e precisão. “Os organismos são identificados Convencionalmente basearam pela maior parte em aspectos tais como seu tamanho, cor e características morfológicas originais,” diz Crous. “Isto causa uma situação onde muitas espécies possam ser identificadas somente pelos peritos taxonomic, que são raramente. Isto pode fazê-lo difícil identificar a espécie assim como novos conhecidos. O ADN que barcoding resolveria todo o este.”

O conceito é simples. Uma amostra do espécime é processada para produzir o código de barras. Isto é combinado então contra uma biblioteca de códigos de barras conhecidos e o espécime é identificado desta maneira.

“Assim se uma expedição de animais exóticos chega nos costumes aponta, você pode determinar muito rapidamente se contem a espécie em vias de extinção ou não e capturar os importadores involvidos,” Crous diz. “Você pode igualmente responder a uma escala inteira de perguntas complexas ecológicas e da biodiversidade.”

Para fazer isto, a base de dados do código de barras deve primeiramente ser construída. O Código de barras Internacional da iniciativa da Vida foi propor por cientistas Canadenses e está levantado 150 milhão Dólares canadianos (apenas sob 100 milhão euro) para o código de barras 500.000 espécies durante os próximos cinco anos. A logística será inevitàvel complexa, assim que a iniciativa está propor uma série de “nós centrais e regionais” financiar e coordenar a actividade através do mundo. Ao longo dos anos espera-se que cada espécie - diversos milhões - será eventualmente com código de barras.