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全球脱氧核糖核酸条形码数据库

Published on June 30, 2008 at 5:36 AM · No Comments

想法 barcoding 跟熟悉许多: 在几乎每个超级市场结算离开运算符显示票标记与一系列的黑色棒到激光扫描器哪些回应与哔哔; 计算机分析这个编码,识别这个产品,并且这个价格被发送到直到。

现在,在雄心勃勃的主动的科学家要运用此概念于生活通过使用脱氧核糖核酸 - 本质的唯一条形码每动物种类、植物和微生物 - 创建每个生存有机体一个浩大的图书馆在这个行星的。 这样一个全球脱氧核糖核酸条形码数据库将证明无价用许多方式,从识别有机体的新的种类和监控生物多样性对检测欺骗。

ECBoL 主动性打算设立网络欧洲主导的实验室 (NELL) 在欧洲中的主要生物多样性资源中心。 此网络将有能力生成种类脱氧核糖核酸条形码在一个工业规模,识别的生活在地球。 一旦设立,这个财团在 5 年内最初有一个目标对条形码 1M 标本,表示 100K 种类。 进一步动议将展开扩展条形码数据库为表示在地球上的所有已知的和未知的寿命。

‘条形码’在生物是对该有机体是唯一的基因的短的顺序。 在动物中,例如,在一个结构的一个特殊基因顺序在称线粒体的这个细胞证明是唯一的对任何特定种类。 相似的顺序为工厂被找到,并且科学家有效地搜索在细菌、真菌和其他微生物的条形码基因。

是必要的这样主动性是国际的在范围,并且在今年 EuroBioForum 会议上在史特拉斯堡在 9月,佩德罗 Crous 教授在生活主动性国际条形码放置欧洲的介入的论点。

“barcoding 的脱氧核糖核酸将允许我们获得对生活的更好的了解,并且生活的更好的升值”, Crous,说是 CBS 霉菌生物多样性中心主任在乌得勒支,荷兰。

barcoding 在传统分类学的脱氧核糖核酸的关键好处识别有机体是在其巨大速度和准确性的潜在。 “有机体常规被识别主要根据方面例如他们的范围,颜色和唯一形态功能”, Crous 说。 “这提升许多种类可以由分类学专家仅确定,稀少是的一种情形。 这可能使它难识别已知的种类以及新的。 barcoding 的脱氧核糖核酸将解决所有此”。

这个概念是简单的。 这个标本的范例被处理生产条形码。 这然后与已知的条形码相符图书馆,并且这个标本这样被识别。

“如此,如果异乎寻常的动物的发运到达自定义指向,您能非常迅速确定,如果它包含濒于灭绝的物种或没有和请捉捕包含的进口商”, Crous 说。 “您能也回答各种各样的复杂生态和生物多样性问题”。

要执行此,必须首先修建条形码数据库。 生活主动性国际条形码由加拿大科学家建议和寻求筹集 150 百万加拿大元 (在 100 百万欧元以下) 到条形码 500,000 种类以后五年。 这个采购管理系统不可避免地将是复杂的,因此主动性建议一系列的中央和地区 ‘节点’资助和协调在这个世界的活动。 多年来期待每个种类 - 几百万 - 最终将是后备地址寄存码的。

“欧洲将是一个中央节点,并且在此合格筹集 25 百万美元在欧洲是必要的”, Crous 说。 “欧洲在此主动性需要扮演一个主角。 我们有惊人的收藏 在过去世纪期间被会集了 - 的博物馆和干燥标本集在地球上已知的大部分的所有种类在欧洲收藏表示。 我们也有分类学的严格的传统,因此我们是在造成在此域的实际影响的一个唯一地有影响的地位”。

在会见 Crous 的 EuroBioForum 将提出提议对于网络欧洲主导的实验室 (NELL) 执行大多数这个 barcoding 的工作。 “在我们有有协调员的八或九欧洲国家地区做到此建议”时 Crous 说。 “什么我们要达到在 EuroBioFund 会议上是从支持生物多样性研究承诺给此欧洲 barcoding 的市场活动的行业和政府获得承诺”。

因为技术开发, barcoding 将变得越来越简单,并且普遍, Crous 预测。 “其中一个最终目标是开发一手持式脱氧核糖核酸 barcoder”, Crous 说。 “这听起来非常未来派,但是不是一样牵强附会的,象它也许似乎。 已经人们有基因排序的可移植的技术。 有能发送条形码数据到符合的一个中央数据库和接受这个结果的无线技术。 仍然需要什么是全部的平台 - 整个范例准备的小型化。 但是多种组在此从事”。

一个手持式系统在雨林里将允许人执行标本的即时确定在这个域的 -,例如或者,离家较近,在微生物学家需要识别致病性有机体的医院。 例如,增加计算免疫抑制患者开发与未以前叫作病原生物的有机体的传染。 新颖的疾病的快速和可靠的确定可能拯救那些患者生命。

“Barcoding 是远期”, Crous 推断。 “它是罪孽,如果欧洲,以其富有的收藏和其唯一专门技术在分类学方面,不起其作用”。

http://www.esf.org