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全球脫氧核糖核酸條形碼數據庫

Published on June 30, 2008 at 5:36 AM · No Comments

想法 barcoding 跟熟悉許多: 在幾乎每個超級市場結算離開運算符顯示票標記與一系列的黑色棒到激光掃描器哪些回應與嗶嗶; 計算機分析這個編碼,識別這個產品,并且這個價格被發送到直到。

現在,在雄心勃勃的主動的科學家要運用此概念於生活通過使用脫氧核糖核酸 - 本質的唯一條形碼每動物種類、植物和微生物 - 創建每個生存有機體一個浩大的圖書館在這個行星的。 這樣一個全球脫氧核糖核酸條形碼數據庫將證明無價用許多方式,從識別有機體的新的種類和監控生物多樣性對檢測欺騙。

ECBoL 主動性打算設立網絡歐洲主導的實驗室 (NELL) 在歐洲中的主要生物多樣性資源中心。 此網絡將有能力生成種類脫氧核糖核酸條形碼在一個工業規模,識別的生活在地球。 一旦設立,這個財團在 5 年內最初有一個目標對條形碼 1M 標本,表示 100K 種類。 進一步動議將展開擴展條形碼數據庫為表示在地球上的所有已知的和未知的壽命。

『條形碼』在生物是對該有機體是唯一的基因的短的順序。 在動物中,例如,在一個結構的一個特殊基因順序在稱線粒體的這個細胞證明是唯一的對任何特定種類。 相似的順序為工廠被找到,并且科學家有效地搜索在細菌、真菌和其他微生物的條形碼基因。

是必要的這樣主動性是國際的在範圍,并且在今年 EuroBioForum 會議上在史特拉斯堡在 9月,佩德羅 Crous 教授在生活主動性國際條形碼放置歐洲的介入的論點。

「barcoding 的脫氧核糖核酸將允許我們獲得對生活的更好的瞭解,并且生活的更好的升值」, Crous,說是 CBS 黴菌生物多樣性中心主任在烏得勒支,荷蘭。

barcoding 在傳統分類學的脫氧核糖核酸的關鍵好處識別有機體是在其巨大速度和準確性的潛在。 「有機體常規被識別主要根據方面例如他們的範圍,顏色和唯一形態功能」, Crous 說。 「這提升許多種類可以由分類學專家仅確定,稀少是的一種情形。 這可能使它難識別已知的種類以及新的。 barcoding 的脫氧核糖核酸將解決所有此」。

這個概念是簡單的。 這個標本的範例被處理生產條形碼。 這然後與已知的條形碼相符圖書館,并且這個標本這樣被識別。

「如此,如果異乎尋常的動物的發運到達自定義指向,您能非常迅速確定,如果它包含瀕於滅绝的物種或沒有和请捉捕包含的進口商」, Crous 說。 「您能也回答各種各樣的複雜生態和生物多樣性問題」。

要執行此,必須首先修建條形碼數據庫。 生活主動性國際條形碼由加拿大科學家建議和尋求籌集 150 百萬加拿大元 (在 100 百萬歐元以下) 到條形碼 500,000 種類以後五年。 這個採購管理系統不可避免地將是複雜的,因此主動性建議一系列的中央和地區 『節點』資助和協調在這個世界的活動。 多年來期待每個種類 - 幾百萬 - 最終將是後備地址寄存碼的。

「歐洲將是一個中央節點,并且在此合格籌集 25 百萬美元在歐洲是必要的」, Crous 說。 「歐洲在此主動性需要扮演一個主角。 我們有驚人的收藏 在過去世紀期間被會集了 - 的博物館和乾燥標本集在地球上已知的大部分的所有種類在歐洲收藏表示。 我們也有分類學的嚴格的傳統,因此我們是在造成在此域的實際影響的一個唯一地有影響的地位」。

在會見 Crous 的 EuroBioForum 將提出提議對於網絡歐洲主導的實驗室 (NELL) 執行大多數這個 barcoding 的工作。 「在我們有有協調員的八或九歐洲國家地區做到此建議」時 Crous 說。 「什麼我們要達到在 EuroBioFund 會議上是從支持生物多樣性研究承諾給此歐洲 barcoding 的市場活動的行業和政府獲得承諾」。

因為技術開發, barcoding 將變得越來越簡單,并且普遍, Crous 預測。 「其中一個最終目標是開發一手持式脫氧核糖核酸 barcoder」, Crous 說。 「這聽起來非常未來派,但是不是一樣牽強附會的,像它也許似乎。 已經人們有基因排序的可移植的技術。 有能發送條形碼數據到符合的一個中央數據庫和接受這個結果的無線技術。 仍然需要什麼是全部的平臺 - 整個範例準備的小型化。 但是多種組在此從事」。

一個手持式系統在雨林裡將允許人執行標本的即時確定在這個域的 -,例如或者,離家較近,在微生物學家需要識別致病性有機體的醫院。 例如,增加計算免疫抑制患者開發與未以前叫作病原生物的有機體的傳染。 新穎的疾病的快速和可靠的確定可能拯救那些患者生命。

「Barcoding 是遠期」, Crous 推斷。 「它是罪孽,如果歐洲,以其富有的收藏和其唯一專門技術在分類學方面,不起其作用」。

http://www.esf.org