Nouvel outil identifie les gènes affectant la santé

Un nouvel outil qui permet d'extraire des informations sur la santé de génotypes dans une fraction de seconde, a été développé par un universitaire de l' Université de Southampton.

Dans un article intitulé stimuler haplotypes inférence avec recherche locale, vient de publier dans contraintes : An International Journal, professeur Joao Marques-Silva, à l'Université, école d'électronique et informatique et collaborateurs, décrire une nouvelle approche pour le processus d'inférence haplotypes information de données génotype.

Un haplotype peut être défini comme un groupe d'allèles d'un ou de plusieurs gènes sur un seul chromosome qui sont assez étroitement liées à être héritée habituellement comme une unité et un génotype se réfère à la combinaison d'allèles héritée des deux parents.

Selon le professeur Marques-Silva, la méthode actuelle d'extraire les haplotypes des données génotype est basée sur des approches statistiques, qui peuvent prendre beaucoup de temps à calculer.

Professeur Marques-Silva et collaborateurs se sont approchés à ce scénario en prenant l'inférence haplotypes par Pure parcimonie (HIPP), une solution qui minimise le nombre total d'haplotypes distincts utilisés et mis au point de nouveaux algorithmes de qui ils ont demandé à obtenir des résultats plus rapides.

« Biologistes utilisent ces approches statistiques depuis longtemps et peuvent ne pas être ouvert au changement », dit-il. « Cependant, ces méthodes peuvent prendre des jours, même mois de clore, tandis que notre approche produit un résultat presque instantané. »

De plus amples recherches effectue actuellement par le professeur Marques-Silva et ses collaborateurs pour valider cette nouvelle méthode et pour prouver qu'il pourrait remplacer les méthodes statistiques dans un certain nombre de paramètres.

« C'est le plus grand développement que nous avons fait jusqu'ici, dans ce domaine », a dit le professeur Marques-Silva. « Il reste à voir si les biologistes cela utilisera plutôt que des techniques existantes ».

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