Nuovo strumento identifica i geni che incidono sulla sanità

Un nuovo strumento che rende possibile per estrarre informazioni sulla salute di un individuo da genotipi in una frazione di secondo, è stato sviluppato da un accademico presso l' Università di Southampton.

In un libro intitolato il potenziamento di inferenza aplotipo con ricerca locale, appena pubblicato vincoli: An International Journal, Professor Joao Marques-Silva, presso dell'università scuola di elettronica e informatica e collaboratori, descrivere un nuovo approccio al processo di deduzione di aplotipo informazione dai dati di genotipo.

Un aplotipo può essere definito come un gruppo di alleli di uno o più geni su un singolo cromosoma abbastanza strettamente collegati a essere ereditata solitamente come un genotipo l'unità si riferisce alla combinazione di alleli ereditato da entrambi i genitori.

Secondo il Professor Marques-Silva, il metodo di estrazione di aplotipi da dati genotipo si basa su approcci statistici, che possono richiedere molto tempo per calcolare.

Professor Marques-Silva e collaboratori si avvicinò questo scenario prendendo l'illazione aplotipo da puro parsimonia (HIPP), una soluzione che riduce al minimo il numero totale di aplotipi distinto utilizzato e sviluppato nuovi algoritmi che hanno applicato per ottenere risultati più velocemente.

'I biologi hanno utilizzato questi approcci statistici per lungo tempo e non può aprire per cambiare', ha detto. 'Tuttavia, questi metodi possono prendere giorni, addirittura mesi per terminare, considerando che il nostro approccio produce un risultato quasi istantaneo.'

Ulteriori ricerche è stati effettuati attualmente da professore Marques-Silva e collaboratori per convalidare questo nuovo metodo e per dimostrare che esso potrebbe sostituire i metodi statistici in una serie di impostazioni.

'Questo è il più grande sviluppo che abbiamo fatto finora, in questo campo', ha detto il Professor Marques-Silva. 'Resta da vedere se i biologi userà questo invece di tecniche esistenti'.

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