Vaikka jokaiseen soluun kehossamme sisältää samat geneettiset ohjeet, tiettyjä geenejä tyypillisesti toimivat vain tietyissä soluissa erityisesti aikoina. Muut geenit ovat "vaiennettu" eri tavoin. Yksi tila geenien riippuu miten DNA, geneettinen materiaali on pakattu ydin solut.
Kun pakattu hyvin tiukasti noin kompleksit proteiineja kutsutaan histones, DNA kaksoiskierre on muuttunut fyysisesti saavuttamattomissa molekyylejä, jotka välittävät geenien ilmentymistä. Nyt tutkijaryhmä, joka sisältää Michael Q. Zhang, Ph.D., professori Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) , on julkaissut kattavan analyysin muutoksen malleja histones.
Käyttämällä uutta teknologiaa nimeltä ChIP-Seq, joukkue tunnistettu 39 histoni muutoksia, kuten "ydinjoukko" 17 muutoksia, jotka yleensä esiintyvät yhdessä ja olivat yhteydessä geenien havaittiin olevan aktiivinen.
Tutkijat ovat pitkään tienneet, että kemialliset muutokset erityisesti paikoissa histoni komplekseja vaikuttaa siihen, miten tiukasti DNA on kiedottu histones. "On kuitenkin tärkeää tietää erityisesti muutoksia esiintyy yhdessä ominaisuus kuvioita, tai jos näistä kuvioista voi ennustaa geenien toimintaa", tohtori Zhang selitti.
Ytimessä joukkueen pyrkimyksiä selvittää tämän, Keji Zhao, Ph.D., National Heart, verta ja Lung Institute of National Institutes of Health, ja hänen kollegansa kehittänyt menetelmän, kartta muutoksia ihmisen valkosolujen kutsutaan CD4 + T-soluja. Ensin he käyttivät entsyymi leikata DNA lyhyiksi segmentteihin, jotka pysyivät kiinni histoni "puolaa." Kunkin 39 eri histoni muutoksia, tutkijat käyttivät vasta poimia vastaavia histoni-DNA yhdistelmiä. Lopulta he käyttivät Chip-Seq DNA-sekvensointi teknologia mitkä genomin osista oli sidottu kunkin muutettu histoni.
Joukkueen viimeisimmät tutkimus julkaistiin heinäkuun 2008 kysymystä Nature Genetics, kartat DNA paikoissa, jotka sitoutuvat histones sisältävä molekyyli kokoonpanot kutsutaan asetyyliryhmiä 18 eri tehtävissä "hännät" on histoni proteiineja. Tutkijat yhdessä näitä tietoja aikaisemmin kartat 19 eri muutoksia kutsutaan metylaatio muutoksia, ja joka vaihtaa yhden histoni proteiineja tunnettu variantti.
Useilla muutoksilla osoitti selvästi erottuva "persoonallisuuksia", kukin mieluiten kanssaan erityisesti sääntelyn alueiden geenit.
Mapping useita muutoksia ansiosta tutkijat tutkia, onko erityyppisiä yleensä esiintyvät yhdessä samantyyppistä DNA sääntelyn alueet. He havaitsivat, että joitakin toistuvia yhdistelmiä ei esiinny usein at "hakijan" ja "tehostajana" alueilla DNA, jonka tiedetään lisäävän aktiivisuutta lähellä geenejä. Erityisesti joukkueen tunnistaa yhden yhdistelmän 17 muutoksia, joka oli läsnä yli neljännes enemmän kuin 12000 promoottori alueilla he tutkivat.