Även Om varje cell av vårt förkroppsligar innehåller de samma genetiska anvisningarna, specifika gener agerar typisk endast i specifika celler på särskilda tider. Andra gener ”tystas” i en variation av väg. Ett funktionsläge av att tysta för gen beror på långt DNAEN, det genetiska materiellt, packas i nucleusen av celler.
När du packas runt om komplex av proteiner kallade mycket, stramt histones, DNA-dubblettspiralen framförs fysiskt oåtkomligt till molekylar som medlar genuttryck. Nu Fjädrar har ett forskninglag, som inkluderar Michael Q. Zhang, Ph.D., en professor på Förkylning, HamnLaboratoriumet (CSHL), publicerat en omfattande analys av ändring mönstrar i histones.
Genom Att Använda en ny teknik kallade Gå i flisor-Seq, identifierade laget 39 histoneändringar, däribland ”kärna ur uppsättningen” av 17 ändringar som ansade för att uppstå tillsammans och var tillhörande med gener som observerades för att vara aktivet.
Forskare har långt bekant som kemiska ändringar på särskilda lägen i histonekomplexpåverkan hur stramt DNAEN slås in runt om histonesna. ”Bara det är viktigt att veta att huruvida särskilda ändringar uppstår i kännetecken mönstrar tillsammans, eller, om dessa mönstrar, kan förutsäga genaktiviteter,” Dr. Zhang förklarade.
På hjärtan av lagets försök att bestämma detta, framkallade Keji Zhao, Ph.D., av MedborgareHjärtan, Blod och LungInstitutet av MedborgareInstituten av Vård- och hans kollegor en metod för att kartlägga ändringar i celler för människavitblod som var bekant som CD4+-T-celler. Först använde de ett enzym för att klippa DNAEN in i kort stavelse segmenterar, som återstod fäst till histonen ”köar.”, För varje av 39 distinkt histoneändringar använde forskarna en antikropp till extraktet som matchar kombinationer histone-DNA. Slutligen använde de denSeq DNA-ordnande i viss följd teknologin för att bestämma vilka delar av genom var destinerade till varje typ av den ändrade histonen.
Lagets nyaste forskning som publiceras i Juli 2008 utfärdar av NaturGenetik, kartlägger DNA-lägena att röran till histones som innehåller molekylära konfigurationer som kallas acetylgrupper på olika 18 placerar i ”svanarna” av histoneproteinerna. Forskarna kombinerade denna information med tidigare kartlägger för 19 olika ändringar som kallades methylationändringar och för utbyte av ett av histoneproteinerna med en välkänd variant.
De olika ändringarna visade särskiljande ”personligheter,” varje som förbinder prioriterat med särskilda reglerande regioner av gener.
att Kartlägga många ändringar möjliggjorde forskarna för att undersöka huruvida olika typer ansar för att synas tillsammans i den samma typen av reglerande regioner för DNA. De grundar att några återkommande kombinationer uppstod vanligt på ”tillskyndare-” och ”enhancer” regioner i DNA, som är bekant till förhöjning aktiviteten av närliggande gener. I synnerhet identifierade laget en kombination av 17 ändringar, som var närvarande i mer, än en inkvartera av de mer än 12.000 tillskyndareregionerna som de undersökte.